奶牛在飼養過程中會經常性的感染大量有害病菌。例如乳牛食入了被農藥或放射性物質汙染的飼料和水。而飼養牛奶的農戶為促進牛體正常生長並且要治療疾病，對乳牛使用一些激素和抗生素。這些激素、抗生素、放射性物質和農藥就會透過牛機體進入牛乳中，對牛乳造成汙染。實驗證明，即使乳中含有微量的抗生素，也可成為人對抗生素產生過敏或增加抗藥性的原因，因此有害於大眾健康。同時影響發酵乳製品的生產。

不過現在大型生產乳製品的企業嚴把原料奶的質量關，採用先進的科學檢測手段，防止含有抗生素的牛奶流入市場。也就是所說的無抗奶。

牛奶是營養比較全面，最容易被人體吸收的食品。但是，當人們喝下一杯牛奶時，有可能把殘留在牛奶中的抗生素也喝進了體內。一些牛奶問題專家警告說，在大力提倡、推廣喝牛奶的今天，含有抗生素殘留的牛奶(簡稱為“有抗奶”)作為食品汙染源，正隨著喝奶群體的擴大，汙染面也在擴大。 “奶牛吃藥，人吃藥奶” 　　浙江大學動物科學學院方維煥教授等人介紹說，牛奶中抗生素殘留是全世界奶牛業普遍存在的問題，這是因為奶牛場均用抗生素類藥物治療奶牛疾病。據調查，目前中國一般奶牛場中奶牛乳腺炎的患病率在30%左右。 　　使用抗生素治療奶牛這些疾病的主要途徑有兩種：一是區域性用藥，即將抗生素直接注入患病奶牛的乳房或子宮；二是肌肉或靜脈注射。在這兩種方法中，將藥物直接注入乳房顯然可以造成抗生素在牛奶中的殘留，採用肌肉或靜脈注射這種方式，由於藥物可以透過血液迴圈系統進入乳房和牛奶中，也可以引起牛奶中的抗生素殘留。即使是治癒後的3-4天內，抗生素也會殘留在奶牛的體內，移行到乳腺裡、牛奶中。 浙江大學獸醫專家高慶田說，這些在用藥3天內採集的牛奶中會殘留部分抗生素，它同受農藥汙染、放射性汙染的牛奶一樣，屬於異物汙染物，是不能食用的異常乳。長期以來，中外治療奶牛乳腺炎的藥物只有青黴素、鏈黴素等抗生素。這些年來奶牛對抗生素的耐藥性越來越強，療效也越來越差，所以治療乳腺炎時使用的劑量越來越大，殘留在奶牛及牛奶中的抗生素也越來越多、越來越濃。 高慶田說，長期飲用“有抗奶”，會使正常人被動接受、積累抗生素，造成人體生理紊亂，對抗生素產生耐藥性。當患病時再用抗生素治療，效果就會下降，而醫生往往對治療無效的原因又不易查明，導致延誤病情，耽誤治療；遇到這種情況，醫生有時會加大抗生素使用量或使用更高效的抗生素，結果更糟。此外，有些先天對抗生素過敏的人長期喝“有抗奶”之後，會造成過敏性休克，甚至危及生命。另外，含有抗生素殘留的牛奶中除了有抗生素殘留外，還可能帶有病菌、毒菌及異常細胞等對人體有害的成分。 　　有人曾試圖以加熱來消除抗生素殘留，但實驗證明，由於一般抗生素對熱的穩定性高，牛奶加熱殺菌無法將其破壞，實際收效並不明顯。如青黴素若在62攝氏度下，經30分鐘熱處理，其含量僅減少3.2%，若在71攝氏度下，經30分鐘熱處理其含量僅減少10.1%，若在121攝氏度下，經30分鐘熱處理，其含量僅減少59.7%。這樣，混有抗生素牛奶的原料乳加工成消毒奶等乳製品後，仍有大部分抗生素殘留。