簡單點說吧: 萬克爾藏著一張 雅克布 不知道的王牌，還原了雅克布陷害邁克爾的證據，最後雅克布被捕，放到FOCUS河監獄。
大結局是這樣的:雅克布抓了邁克爾的兒子，對其洗腦。
而當雅各布和艾米麗趕到動物園搜尋邁克爾蹤跡時，梭羅打來電話，邁克爾手掌上的眼睛紋身已經破解出來了，是拿破崙的名言“永遠不要在敵人犯錯時打斷他們”。雅各布這才意識到中了調虎離山之計。 此刻邁克爾正站在雅各布的辦公室門外，紋身的秘密並不在手掌，而是在手背。只見他雙手捂臉，手背上紋的雅各布臉型成功騙過了面部識別系統。邁克爾拿到了伺服器上的硬碟，掌握了21真空組織的全部秘密，但雅各布手裡有麥克，二人似乎都奈何不了對方。於是在電話裡，邁克爾和雅各布約定次日下午五時在船塢見面。而莎拉在醫院裡並沒有見到林肯。原來林肯執意出院，來到了盧卡的倉庫。這一次他叫來了真正的緝毒組，為自己報了一箭之仇。雖然沒見到林肯，莎拉卻有意外收穫。幾乎同時被送到醫院的梵就在重症監護室，他躺在病床上，喉嚨被切開插著呼吸機。梵此刻已無法說話，他掙扎著拿起筆寫下了安置麥克的地點。 茶包哥和維普順利的在汽車旅館找到了邁克爾所說的王牌，“藍色夏威夷人”。“夏威夷人”只是綽號，他最擅長的就是重建場景。邁克爾執行任務時，在監獄裡認識了他。出於憐憫救他出獄，現在到了他發揮特長的時間。 各人的任務都已完成，在老地方碰頭時，林肯也來了。最後決戰的時刻終於來臨。 次日，邁克爾與雅各布在船塢見面。雅各布有恃無恐，仍拒絕交出麥克。當邁克爾掏出槍後，艾米麗出現，迫使邁克爾將手槍交給了雅各布。哪知維普意外出現，可馬上就被艾米麗射傷並繳械。躲在暗處的茶包哥見兒子受傷，一時緊張衝了出來。遠處傳來警笛聲，雅各布事先通知聯調局，前來抓捕恐怖份子卡尼爾·烏提斯。維普聞言心情激動，上前搶奪艾米麗手中的槍。可他忘了艾米麗手上還有把剛繳獲的手槍，兩聲槍響，維普痛苦的倒在地上。為了不再讓其他人受到傷害，邁克爾答應交出硬碟。見雅各布押著邁克爾去取硬碟，聯調局的應急小隊已經衝進船塢，茶包哥不顧一切的用機械手扭斷艾米麗的脖子，為兒子報仇血恨。 雅各布押著邁克爾走向船塢深處，邁克爾的手機響起。莎拉和林肯已根據梵所說的地點，在學院的另一處救出了麥克，還抓住了梭羅。雅各布自知大事不妙，索性要殺邁克爾滅口。只要邁克爾死了，就死無對證，也不會有人知道硬碟的下落。突然，遠處傳來應急小組的聲音，邁克爾趁雅各布分神之際，逃進一個小門。雅各布追進小門，向邁克爾連開兩槍。開槍後才發現，小門後是仿林間小屋的背景。他槍殺哈倫的情景被再現。 再現情景只是邁克爾計劃的一部分。邁克爾進入辦公室不僅取走了硬碟，還將瓶中哈倫的鮮血抹在了辦公室裡，再加上硬盤裡的證據和梭羅的口供，中情局破獲了內部的反叛組織，也還給了邁克爾真實身份和自由。 邁克爾、莎拉，還有林肯、希巴享受自由的Sunny時，雅各布也面帶笑容的住進了FOCUS河監獄。他自信不會呆太長時間，可睡在上鋪的茶包哥站在他面前時，雅各布臉上的笑容凝固了。
簡單點說吧: 萬克爾藏著一張 雅克布 不知道的王牌，還原了雅克布陷害邁克爾的證據，最後雅克布被捕，放到FOCUS河監獄。
大結局是這樣的:雅克布抓了邁克爾的兒子，對其洗腦。
而當雅各布和艾米麗趕到動物園搜尋邁克爾蹤跡時，梭羅打來電話，邁克爾手掌上的眼睛紋身已經破解出來了，是拿破崙的名言“永遠不要在敵人犯錯時打斷他們”。雅各布這才意識到中了調虎離山之計。 此刻邁克爾正站在雅各布的辦公室門外，紋身的秘密並不在手掌，而是在手背。只見他雙手捂臉，手背上紋的雅各布臉型成功騙過了面部識別系統。邁克爾拿到了伺服器上的硬碟，掌握了21真空組織的全部秘密，但雅各布手裡有麥克，二人似乎都奈何不了對方。於是在電話裡，邁克爾和雅各布約定次日下午五時在船塢見面。而莎拉在醫院裡並沒有見到林肯。原來林肯執意出院，來到了盧卡的倉庫。這一次他叫來了真正的緝毒組，為自己報了一箭之仇。雖然沒見到林肯，莎拉卻有意外收穫。幾乎同時被送到醫院的梵就在重症監護室，他躺在病床上，喉嚨被切開插著呼吸機。梵此刻已無法說話，他掙扎著拿起筆寫下了安置麥克的地點。 茶包哥和維普順利的在汽車旅館找到了邁克爾所說的王牌，“藍色夏威夷人”。“夏威夷人”只是綽號，他最擅長的就是重建場景。邁克爾執行任務時，在監獄裡認識了他。出於憐憫救他出獄，現在到了他發揮特長的時間。 各人的任務都已完成，在老地方碰頭時，林肯也來了。最後決戰的時刻終於來臨。 次日，邁克爾與雅各布在船塢見面。雅各布有恃無恐，仍拒絕交出麥克。當邁克爾掏出槍後，艾米麗出現，迫使邁克爾將手槍交給了雅各布。哪知維普意外出現，可馬上就被艾米麗射傷並繳械。躲在暗處的茶包哥見兒子受傷，一時緊張衝了出來。遠處傳來警笛聲，雅各布事先通知聯調局，前來抓捕恐怖份子卡尼爾·烏提斯。維普聞言心情激動，上前搶奪艾米麗手中的槍。可他忘了艾米麗手上還有把剛繳獲的手槍，兩聲槍響，維普痛苦的倒在地上。為了不再讓其他人受到傷害，邁克爾答應交出硬碟。見雅各布押著邁克爾去取硬碟，聯調局的應急小隊已經衝進船塢，茶包哥不顧一切的用機械手扭斷艾米麗的脖子，為兒子報仇血恨。 雅各布押著邁克爾走向船塢深處，邁克爾的手機響起。莎拉和林肯已根據梵所說的地點，在學院的另一處救出了麥克，還抓住了梭羅。雅各布自知大事不妙，索性要殺邁克爾滅口。只要邁克爾死了，就死無對證，也不會有人知道硬碟的下落。突然，遠處傳來應急小組的聲音，邁克爾趁雅各布分神之際，逃進一個小門。雅各布追進小門，向邁克爾連開兩槍。開槍後才發現，小門後是仿林間小屋的背景。他槍殺哈倫的情景被再現。 再現情景只是邁克爾計劃的一部分。邁克爾進入辦公室不僅取走了硬碟，還將瓶中哈倫的鮮血抹在了辦公室裡，再加上硬盤裡的證據和梭羅的口供，中情局破獲了內部的反叛組織，也還給了邁克爾真實身份和自由。 邁克爾、莎拉，還有林肯、希巴享受自由的Sunny時，雅各布也面帶笑容的住進了FOCUS河監獄。他自信不會呆太長時間，可睡在上鋪的茶包哥站在他面前時，雅各布臉上的笑容凝固了。