從探究在探究主體認識世界的眾多方式中的地位來說，兒童自發的探究基本上是兒童認識世界的主要方式，科學家的探究也是科學家深化人類對世界的認識的主要方式(沒有人告訴科學家答案是什麼)。但對於中小學生來說，教師指導下的探究卻只是他們認識世界的方式之一。因為兒童在中小學階段不學習大量必需的、基礎的科學文化知識是無法適應現代社會與生活的需要的。而且兒童既沒有足夠的時間、充分的條件和能力對所有這些知識都經歷探究的過程，也沒有這個必要。因此，直接的“授受式學習”也是中小學生學習的重要方式，這是毫無疑問的。

其次，兒童自發的探究與科學家的探究都基本上是在沒有外部指導的情況下自主開展的，儘管在探究的諸多實踐中，兒童和科學家也可以透過自己的反思和相互間的交流，來總結經驗與教訓，從而不斷提高自己的探究能力與水平，但那基本上是一種自我教育的長期摸索模式。教師指導下的探究則是一種迅速提高學生探究能力的省時學習與發展模式，為了提高學生的探究能力，教師對於如何安排探究、探究過程中學生自主活動的重點是什麼、教師重點指導哪些方面、如何指導及何時介入等問題，都要有自己的思考和原則。

第三，兒童自發的探究計劃性不強，常常隨興所至。科學家的探究則有科學的研究計劃，甚至有自主制訂的五年規劃、十年規劃。教師指導下的探究也有九年規劃與三年規劃(義務教育九年，高中三年)，但那基本上是從外部由教育者制訂的(雖然制訂的過程要遵循兒童身心發展規律)。