1、體內寄生蟲。這類寄生蟲寄生在水生動物的內部器官、血液、腸道和其他組織中，如艾美蟲、各種絛蟲、血吸蟲等。

2、體外寄生蟲。這類寄生蟲寄生在水生動物的體表、鰓、鰭等處，如指環蟲、錨頭鰠、魚鯴等。

縮頭魚蝨，全世界共有42屬347種，它們主要寄生在魚類的體內（嘴裡也有的），大多數寄生海魚，少數寄生淡水魚，成體大約有3到4釐米長，不過成長史就有些恐怖。

幼體首先附到魚鰓上，長成雄性個體，成熟之後縮頭魚蝨變成雌性，然後在魚鰓上完成交配，之後雌蟲穿過魚鰓進入到魚的口腔，前端足緊緊抓住魚舌，開始吸取血液直至其完全萎縮。

接下來，縮頭魚蝨就佔據了魚舌的位置，取代魚舌後，縮頭魚蝨仍會以魚的血液為食，與魚一起共度餘生。

魚類常見寄生蟲有：

扁彎口吸蟲、錨頭鰠、中華鰠、孢子蟲（胞囊）、球蟲（艾美蟲胞囊）、碘泡蟲（胞囊）、絛蟲、九江頭槽絛蟲、孢子蟲

魚類屬於水生動物，魚類寄生蟲按其所寄生的部位可以分為兩類：　　1、體內寄生蟲。這類寄生蟲寄生在水生動物的內部器官、血液、腸道和其他組織中，如艾美蟲、各種絛蟲、血吸蟲等。　　2、體外寄生蟲。這類寄生蟲寄生在水生動物的體表、鰓、鰭等處，如指環蟲、錨頭鰠、魚鯴等。　　在選用抗寄生蟲藥物時，要了解和掌握該藥物對蟲體的作用機理，對寄生蟲的毒性以及在宿主體內的作用，只要選擇了合適的藥物給予最佳的藥量才能達到最好的治療效果，以免浪費藥物和傷害宿主。　　寄生蟲藥物可以分為抗原蟲藥物、殺甲殼動物藥物、抗蠕蟲藥物和除害藥物。