（1)外觀不同

花椒：花椒在生時為青色，在成熟之後為暗紅色，顏色很重，其中的籽為黑色。

麻椒：麻椒在生時也是青色，但是在成熟之後是棕色偏黃，顏色較淺，籽也是黑色。

(2)口味不同

花椒：花椒香味重、麻味較輕，常用來和肉類一起烹飪，能清除肉類的腥味和哈味，增加香氣。

麻椒：麻椒的香味較輕，而麻味極重，常用來做川菜的調味品，在火鍋中比較常見。

(3)用途不同

花椒：花椒常用來做調味品，同時也是很多中藥方和民間偏方的主要藥材之一。

麻椒：麻椒做調味品倒是很少，僅僅在川菜中使用，最主還是用來提煉麻油。

(4)營養成分差別

花椒和麻椒在營養成分上有很大的相似之處，除了至麻味的檸檬烯成分麻椒含量高出花椒很多，其他都差不多，因此，在很多時候可用麻椒代替花椒使用，但是麻椒的毒性比花椒也大一些，食用量也應該更小。

麻椒是四川省、貴州省地區特產的一種花椒。麻椒顏色淺，成熟後為深綠色，風乾後偏棕黃色；花椒顏色重，偏棕紅色。麻椒的味道比花椒重，特別麻。 在川菜中麻椒佔有很大的地位。

花椒（學名：Zanthoxylum bungeanum Maxim.）是芸香科、花椒屬落葉小喬木；高可達7米的莖幹上的刺常早落，枝有短刺，葉有小葉片，葉軸常有甚狹窄的葉翼；小葉片對生，無柄，卵形，橢圓形，稀披針形，位於葉軸頂部的較大，葉緣有細裂齒，齒縫有油點。其餘無或散生肉眼可見的油點，中脈在葉面微凹陷，花序頂生或生於側枝之頂，花序軸及花梗密被短柔毛或無毛；花被片黃綠色，形狀及大小大致相同；雌花很少有發育雄蕊，有心皮，花柱斜向背彎。果紫紅色，單個分果瓣散生微凸起的油點，頂端有甚短的芒尖或無；4-5月開花，8-9月或10月結果。