如果已經入賬開出發票需要明確以下幾點：

1.是否有合同制約

2.同意開票是否有實際檔案證明

3.開票時是否簽訂一些約定等書面電子協議

4.自身沒有違約行為

5.對方是手頭緊還是故意拖欠

6.對方是否出現挪用等問題

明確了這些以後根據情況處理：

1.相關人員出面協商

2.律師介入

3.報警處理

4.憑票和錄音等證據起訴

5.強制執行

6.下下策 宣傳引起社會輿論

因您的問題描述不詳盡，本人就假設您已完全履行合同約定義務，且不存在履行瑕疵。現是按合同約定先行向甲方開具發票，然後由甲方向您付款，但是，超過付款期限了，甲方仍不付款。

建議：

1、以貴公司的名義，起草一份書面的《催款函》，函件內容應儘可能寫清楚：按合同約定，甲方本應於 xx年xx月xx日向您付清款項xxx元，現在貴公司多方催討下仍不付款，甲方已嚴重違反合同約定，構成根本違約，如不能在收到本函件之日起xxx日內付款，貴公司將採取包括但不限於媒體曝光、投訴、報警、法院訴訟等途徑維護自己合法權益。……然後用EMS快遞的形式寄出，寫明寄件的內容，以保留證據，待日後不得不訴訟用；

2、如果《催款函》沒有效果，建議找律師發《律師函》，但如果已經確定要訴訟了，就不要發《律師函》了，還是直接進行第三步吧；

3、找律師起訴，一般這類案件都建議做訴前財產保全，相關檔案及證據的準備都有律師處理，就不詳述了。