WTO與關貿總協定即GATT是不同的，WTO是GATT再加上更多的內容。 GATT有兩個含義：一是指一個國際協議，其中包含了從事國際貿易所應遵守的規則；一是指後來建立的用以支援該協議的國際組織。該協議的文字可以比作法律，而該組織就像將議會和法庭合二為一的機構一樣。 GATT作為國際組織已不存在，取而代之的是WTO。但GATT作為協議仍然存在，但已不再是國際貿易的主要規則，而且已被更新。 經過修改，GATT已成為新的WTO協議的一部分。更新後的GATT與《服務貿易總協定》（GATS）和《與貿易有關的智慧財產權協議》（TRIPS）並列，WTO使三者併入一個單一的組織，形成一套單一的規則，並使用單一的爭端解決機制。 GATT與WTO的主要區別是： （1）GATT是臨時性的。GATT從未得到成員國立法機構的批准，其中也沒有建立組織條款。WTO及其協議是永久性的。作為一個國際組織，WTO具有良好的法律基礎，因其成員已經批准WTO協議，而且協議本身規定了WTO如何運作。 （2）WTO擁有“成員”，GATT擁有“締約國”，這就說明了這樣一個事實，即從正式角度講GATT只是一個法律文字。 （3）GATT處理貨物貿易，WTO還涉及服務貿易和智慧財產權。 （4）WTO爭端解決機制與原GATT體制相比，速度更快、更主動，做出的裁決不會受到阻撓