腸道微生物與人類的健康息息相關，我們的糞便就是腸道內包括大腸桿菌在內的眾多微生物綜合作用的結果。

如果腸道微生物菌群失衡，就有可能排便不正常，或者引起腸道不適。為了治療這些問題引起的健康問題，有一種專門的糞便移植手段，實際上就是重新在腸道內培養微生物。

最後的最後，說句斷人財路的話吧……腸道微生物的平衡確實很重要，但是，這並不意味著你可以透過口服菌液或者益生菌之類的就一定可以補充需要的有益微生物了。因為在我們的消化道里，有一道關卡，那就是胃。胃液具有強酸性，它實際上一道消毒工序，強酸性的胃液加上強力的蛋白酶，能夠將多數不耐酸的微生物消滅掉。而我們的腸道環境是弱鹼性，因此，在腸道中生活的微生物很多都可能通不過胃部這一關，除非它有相當的酸性耐受能力。所以，有些食品所謂保健的由頭，你得先查查這種微生物到底是不是酸性耐受的，或者有沒有辦法透過胃酸這一關。

所有腸道微生物對人或者動物的健康有直接相關。若腸道微生物種群越多，你人或動物就自然健康，如果取採單一補充某類別微生物，都會造成腸道某些微生物種類的毀滅或者被排擠，破壞腸道生態平衡，必然會影響健康。例如:人放屁有臭味的，這個人的腸道生態肯定決失。如腸道生態嚴重決失的，其健康情況必定是亞健康或嚴重亞健康。