花椒樹主要病蟲害有；花椒葉鏽病、根腐病、黑脛病（流膠病）和花天牛、潛葉跳甲、銅綠金龜子、桑白蚧、癭蚊等。
１、天牛。在立秋後出現，幼蟲蛀食枝幹，嚴重時造成整株死亡。防治方法：在秋季採收花椒時，將蟲梢徹底剪除燒燬或用鐵絲鉤殺，再用棉花沾上煤油或巴丹粉混合液堵塞蟲蛀孔。
２、鳳蝶。成蟲產卵於嫩芽或嫩葉背面，危害葉子，成鋸齒狀。防治方法：冬季剪枝時注意殺蛹，夏季撲殺成蟲，在植株上噴蚍酸鋁毒殺幼蟲。
３、蚜蟲。主要危害樹葉。防治方法是：在１０月中、下旬清除地中、樹穴、石縫雜草，消除越冬場所，每年４月中旬用１５００倍液樂果乳劑灑射植株，或用1:1000～2000倍鋅硫磷乳油噴霧、或用1:4:400～500洗衣粉、尿素溶液噴霧，防效均可達９５％。
４、葉鏽病。主要危害葉片，高溼的夏秋季容易發病，發病初期椒葉面部呈圓形淡黃色病斑，以後病斑顏色逐漸加深呈黃褐色並有粉末狀橙紅色孢子產生。防治方法：６～８月噴施１～２次0.3～0.5度的石硫合劑或1000倍液甲基託布津。冬季結合修剪將落葉和樹冠下的雜草剷除燒燬，同時噴灑２～３度石硫合劑。
５、根腐病。花椒幼苗，成年椒樹染病後，地下根部呈水腫狀，根皮易脫落，並有異臭味。防治方法：⑴苗圃地應選擇排水良好的沙質土地，苗床應做高廂，並注意排水。不在有根腐病的土壤內育苗。⑵苗期多施磷鉀肥、增強苗木抗病能力。⑶發現成年椒樹染根腐病後，應及時剪除病根，剪口處塗以石硫合劑消毒，並施以草木灰。
６、花椒虎天牛。一般６～７月為成蟲盛發期，此期選擇晴天無風的下午進行人工捕捉成蟲；５～８月適時進行檢查，一旦發現蟲卵粒和幼蟲應及時刮除殺死。藥劑防治每年３～１１月可採取以下方法：⑴用1:20敵敵畏、煤油液塗抹受害樹皮及其周緣處，對三齡幼蟲藥殺效果可達100%。⑵用0.3:1氧化樂果溶液塗抹樹幹基部，可殺死皮下低齡幼蟲。⑶用1:2500倍敵殺死溶液噴灑椒樹觸殺成蟲。⑷成蟲蛀入樹幹的，可採用棉球蘸粘氧化樂果液塞入洞孔內，再用稀泥堵塞窒息。使用敵敵畏煤油液和氧化樂果溶液塗抹樹幹時，注意不能全乾塗抹，否則會發生嚴重藥害。
７、花椒介殼蟲。３月下旬用1:5倍氧化樂果溶液塗抹樹幹，每株１０毫升或以樂果原液注入每株５～１０毫升；５月下旬和８月下旬若蟲蛹散期用1:1000倍液的樂果、敵敵畏溶液噴灑花椒樹幹２～３次。
８、花椒潛葉甲。椒農稱為“火風”，４月下旬椒樹芽初放時可進行防治。⑴用1:1:3:1000倍敵敵畏、樂果、甲胺磷溶液噴霧，花椒嫩梢病害率可降低到１％以下。⑵花椒開花前噴灑１次1:1600～1800倍敵敵畏溶液。⑶花椒謝花後，立即噴灑１次40%樂果乳劑800～1000倍溶液。１０天后再噴灑１次，防止幼蟲轉移危害。
９、花椒葉甲蟲。花椒成熟前後，幼蟲咬食葉肉，許多椒葉部分或全部變成黃色並幹縮，葉背後還出現許多絲狀物和孔洞。如果危害嚴重，將會導致椒樹落葉早，影響下年產量甚至造成植株死亡。防治方法：用1:800～1000久效磷溶液噴霧。使用殺螟松、辛硫磷時由於在Sunny下噴霧不穩定，宜選擇傍晚前後噴霧為好。
花椒樹主要病蟲害有；花椒葉鏽病、根腐病、黑脛病（流膠病）和花天牛、潛葉跳甲、銅綠金龜子、桑白蚧、癭蚊等。
１、天牛。在立秋後出現，幼蟲蛀食枝幹，嚴重時造成整株死亡。防治方法：在秋季採收花椒時，將蟲梢徹底剪除燒燬或用鐵絲鉤殺，再用棉花沾上煤油或巴丹粉混合液堵塞蟲蛀孔。
２、鳳蝶。成蟲產卵於嫩芽或嫩葉背面，危害葉子，成鋸齒狀。防治方法：冬季剪枝時注意殺蛹，夏季撲殺成蟲，在植株上噴蚍酸鋁毒殺幼蟲。
３、蚜蟲。主要危害樹葉。防治方法是：在１０月中、下旬清除地中、樹穴、石縫雜草，消除越冬場所，每年４月中旬用１５００倍液樂果乳劑灑射植株，或用1:1000～2000倍鋅硫磷乳油噴霧、或用1:4:400～500洗衣粉、尿素溶液噴霧，防效均可達９５％。
４、葉鏽病。主要危害葉片，高溼的夏秋季容易發病，發病初期椒葉面部呈圓形淡黃色病斑，以後病斑顏色逐漸加深呈黃褐色並有粉末狀橙紅色孢子產生。防治方法：６～８月噴施１～２次0.3～0.5度的石硫合劑或1000倍液甲基託布津。冬季結合修剪將落葉和樹冠下的雜草剷除燒燬，同時噴灑２～３度石硫合劑。
５、根腐病。花椒幼苗，成年椒樹染病後，地下根部呈水腫狀，根皮易脫落，並有異臭味。防治方法：⑴苗圃地應選擇排水良好的沙質土地，苗床應做高廂，並注意排水。不在有根腐病的土壤內育苗。⑵苗期多施磷鉀肥、增強苗木抗病能力。⑶發現成年椒樹染根腐病後，應及時剪除病根，剪口處塗以石硫合劑消毒，並施以草木灰。
６、花椒虎天牛。一般６～７月為成蟲盛發期，此期選擇晴天無風的下午進行人工捕捉成蟲；５～８月適時進行檢查，一旦發現蟲卵粒和幼蟲應及時刮除殺死。藥劑防治每年３～１１月可採取以下方法：⑴用1:20敵敵畏、煤油液塗抹受害樹皮及其周緣處，對三齡幼蟲藥殺效果可達100%。⑵用0.3:1氧化樂果溶液塗抹樹幹基部，可殺死皮下低齡幼蟲。⑶用1:2500倍敵殺死溶液噴灑椒樹觸殺成蟲。⑷成蟲蛀入樹幹的，可採用棉球蘸粘氧化樂果液塞入洞孔內，再用稀泥堵塞窒息。使用敵敵畏煤油液和氧化樂果溶液塗抹樹幹時，注意不能全乾塗抹，否則會發生嚴重藥害。
７、花椒介殼蟲。３月下旬用1:5倍氧化樂果溶液塗抹樹幹，每株１０毫升或以樂果原液注入每株５～１０毫升；５月下旬和８月下旬若蟲蛹散期用1:1000倍液的樂果、敵敵畏溶液噴灑花椒樹幹２～３次。
８、花椒潛葉甲。椒農稱為“火風”，４月下旬椒樹芽初放時可進行防治。⑴用1:1:3:1000倍敵敵畏、樂果、甲胺磷溶液噴霧，花椒嫩梢病害率可降低到１％以下。⑵花椒開花前噴灑１次1:1600～1800倍敵敵畏溶液。⑶花椒謝花後，立即噴灑１次40%樂果乳劑800～1000倍溶液。１０天后再噴灑１次，防止幼蟲轉移危害。
９、花椒葉甲蟲。花椒成熟前後，幼蟲咬食葉肉，許多椒葉部分或全部變成黃色並幹縮，葉背後還出現許多絲狀物和孔洞。如果危害嚴重，將會導致椒樹落葉早，影響下年產量甚至造成植株死亡。防治方法：用1:800～1000久效磷溶液噴霧。使用殺螟松、辛硫磷時由於在Sunny下噴霧不穩定，宜選擇傍晚前後噴霧為好。