影響電泳泳動度的因素：
1、顆粒性質：顆粒的直徑、形狀及所帶靜電荷量對泳動速度有較大影響。一般來說顆粒帶淨電荷量越多，或其形狀越接近球形，在電場中的泳動速度就越快。反之則越慢。
2、電場強度：電場強度是指每一釐米的電位降。又稱為電位梯度或電勢梯度。它對泳動速度起著十分重要的作用。電場強度越高，帶電顆粒的泳動速度越快。反之，則越慢。根據電場強度（電壓的高低）大小，又可將電泳分為常壓電泳（100－500V）和高壓電泳（500－10000V）。前者電場強度為2－10伏特/釐米，後者為70－200伏特/釐米。常壓電泳多用於分離大分子物質。高壓電泳常需要冷卻裝置。高壓電泳時間短，有時僅需數分鐘，多用於分離小分子物質。
3、溶液的性質：主要是指電極溶液（緩衝溶液）和蛋白質樣品溶液的pH值、離子強度和粘度等。（1）pH值：溶液pH值決定帶電顆粒的解離程度，也即決定其帶淨電荷的量。對蛋白質而言，溶液的pH值離其等電點越遠，則其帶淨電荷量就越多，從而泳動速度就越快。反之，則越慢。當pH值等於其PI時，淨電荷為0，μ也為0。因此電泳時應選擇適宜的PH值，並需採用緩衝溶液，使溶液的pH值恆定。（2）離子強度：溶液的離子強度一般在0.02－0.2之間時，電泳較合適。若離子強度過高，則會降低顆粒的泳動速度。其原因是，帶電顆粒能把溶液中與其電荷相反的離子吸引在自己周圍形成離子擴散層。若離子強度過低，則緩衝能力差，往往會因溶液PH值變化而影響泳動的速率。離子強度的計算公式為：I＝1/2∑mizi2=1/2(m1z12+m2z22+…mnzn2)I－溶液的離子強度；mi－離子的摩爾濃度；zi－離子的價數1，2，…n－代表各種離子。（3）溶液粘度：泳動度與溶液粘度是成反比關係。因此，粘度過大或過小，必然影響泳動度。
4、電滲：當支援物不是絕對惰性物質時，常常會有一些離子基團如羧基、磺酸基、羥基等吸附溶液中的正離子，使靠近支援物的溶液相對帶電。在電場作用下，此溶液層會向負極移動。反之，若支援物的離子基團吸附溶液中的負離子，則溶液層會向正極移動。這種溶液層的泳動現象稱為電滲。因此，當顆粒的泳動方向與電滲方向一致時，則加快顆粒的泳動速度；當顆粒的泳動方向與電滲方向相反時，則降低顆粒的泳動速度。AB//////////////////////////////////////////－－－－++++++++++－++++++++++－－－－+A支援物B支援物5、焦耳熱：在電泳過程中，電流強度與釋放出熱量（Q）之間的關係可列成如下公式：Q＝I2Rt式中R為電阻；t為電泳時間；I為電流強度。公式表明，電泳過程中釋放出的熱量與電流強度的平方成正比。當電場強度或電極緩衝液中離子強度增高時，電流強度會隨著增大。這不僅降低解析度，而且在嚴重時會燒斷濾紙或熔化瓊脂糖凝膠支援物。6、篩孔：支援物瓊脂和聚丙烯醯胺凝膠都有大小不等的篩孔，在篩孔大的凝膠中溶質顆粒泳動速度快。反之，則泳動速度慢。除上述影響泳動速度的因子外，溫度和儀器裝置等因子的影響也應考慮。
影響電泳泳動度的因素：
1、顆粒性質：顆粒的直徑、形狀及所帶靜電荷量對泳動速度有較大影響。一般來說顆粒帶淨電荷量越多，或其形狀越接近球形，在電場中的泳動速度就越快。反之則越慢。
2、電場強度：電場強度是指每一釐米的電位降。又稱為電位梯度或電勢梯度。它對泳動速度起著十分重要的作用。電場強度越高，帶電顆粒的泳動速度越快。反之，則越慢。根據電場強度（電壓的高低）大小，又可將電泳分為常壓電泳（100－500V）和高壓電泳（500－10000V）。前者電場強度為2－10伏特/釐米，後者為70－200伏特/釐米。常壓電泳多用於分離大分子物質。高壓電泳常需要冷卻裝置。高壓電泳時間短，有時僅需數分鐘，多用於分離小分子物質。
3、溶液的性質：主要是指電極溶液（緩衝溶液）和蛋白質樣品溶液的pH值、離子強度和粘度等。（1）pH值：溶液pH值決定帶電顆粒的解離程度，也即決定其帶淨電荷的量。對蛋白質而言，溶液的pH值離其等電點越遠，則其帶淨電荷量就越多，從而泳動速度就越快。反之，則越慢。當pH值等於其PI時，淨電荷為0，μ也為0。因此電泳時應選擇適宜的PH值，並需採用緩衝溶液，使溶液的pH值恆定。（2）離子強度：溶液的離子強度一般在0.02－0.2之間時，電泳較合適。若離子強度過高，則會降低顆粒的泳動速度。其原因是，帶電顆粒能把溶液中與其電荷相反的離子吸引在自己周圍形成離子擴散層。若離子強度過低，則緩衝能力差，往往會因溶液PH值變化而影響泳動的速率。離子強度的計算公式為：I＝1/2∑mizi2=1/2(m1z12+m2z22+…mnzn2)I－溶液的離子強度；mi－離子的摩爾濃度；zi－離子的價數1，2，…n－代表各種離子。（3）溶液粘度：泳動度與溶液粘度是成反比關係。因此，粘度過大或過小，必然影響泳動度。
4、電滲：當支援物不是絕對惰性物質時，常常會有一些離子基團如羧基、磺酸基、羥基等吸附溶液中的正離子，使靠近支援物的溶液相對帶電。在電場作用下，此溶液層會向負極移動。反之，若支援物的離子基團吸附溶液中的負離子，則溶液層會向正極移動。這種溶液層的泳動現象稱為電滲。因此，當顆粒的泳動方向與電滲方向一致時，則加快顆粒的泳動速度；當顆粒的泳動方向與電滲方向相反時，則降低顆粒的泳動速度。AB//////////////////////////////////////////－－－－++++++++++－++++++++++－－－－+A支援物B支援物5、焦耳熱：在電泳過程中，電流強度與釋放出熱量（Q）之間的關係可列成如下公式：Q＝I2Rt式中R為電阻；t為電泳時間；I為電流強度。公式表明，電泳過程中釋放出的熱量與電流強度的平方成正比。當電場強度或電極緩衝液中離子強度增高時，電流強度會隨著增大。這不僅降低解析度，而且在嚴重時會燒斷濾紙或熔化瓊脂糖凝膠支援物。6、篩孔：支援物瓊脂和聚丙烯醯胺凝膠都有大小不等的篩孔，在篩孔大的凝膠中溶質顆粒泳動速度快。反之，則泳動速度慢。除上述影響泳動速度的因子外，溫度和儀器裝置等因子的影響也應考慮。