生物性危害的等級大多以美國的疾病管制中心（CDC）所規範的四等級為主：

第一級：對於人及動物的危害較輕且對於環境的危害為輕微的，主要措施是接觸時要戴上手套，接觸後要洗手以及清洗接觸過的桌面及器皿等。列於此等級的有枯草桿菌、大腸桿菌、水痘等。

第二級：對於人及動物的危害為中等，對於環境的危害為輕微的。列於此等級的有乙型肝炎、丙型肝炎、流行性感冒、萊姆病、HIV、沙門氏桿菌等等之病原體。

第三級：對於人及動物的危害為高度的，對於環境的危害為輕度的。列於此等級的有炭疽熱、瘋牛病、SARS、西尼羅河腦炎、天花、結核菌、黃熱病等等之病原體。

第四級：對於人及動物的危害為最高的，對於環境的危害為最高的。列於此等級的有伊波拉出血熱、登革熱、漢他出血熱、拉薩熱等出血熱疾病的病毒。要處理這個等級的生物性危害物質，需要有間合乎第四級標準的實驗室（BSL4或P4）來進行，這類實驗室要有極嚴格的門禁管制，且必定為負壓隔離，以避免破損時外漏。工作人員與待處理物品必需要做到隔離（如將物品放在負壓的手套箱內或是工作人員穿著完整且獨立供氣的隔離衣）。

另外日本細菌協會訂定了三等級的實驗室及規範：

第一級病原體：

一般微生物學實驗室用，不需特別隔離。

不管制一般訪客的進出。

第二級病原體：

一般的病原性微生物實驗室使用。

運作時管制一般訪客進出。

第三級病原體：

使用雙重門且空調系統與外界隔離。

牆壁、天井、工作臺等表面要洗淨且消毒。

實驗室的空氣需以高效能的過濾裝置（如HEPA）及紫外線殺菌後才可排出。

需要使用負壓隔離的實驗室。

嚴格限制列冊的工作人員才可依標準程式進出。