太倉港，古稱劉家港，始興於隋唐時期。元朝，政府實施漕糧北運，在劉家港沿線建大型碼頭泊位，建立海運倉儲和海事機構，自此長江中下游地區、浙江溫臺等沿海地區、以及日本、琉球、高麗、安南等國的商船都集結於劉家港，劉家港成為“六國碼頭”、“天下第一碼頭”。明朝，劉家港作為鄭和七下西洋起錨地，發展達到鼎盛，成為當時世界上重要的樞紐港。明以後，由於種種原因，港口逐漸沉寂。

改革開放以來，蘇南經濟特別是外向型經濟的快速發展，對港口的開發建設提出了迫切的要求，也為港口開發建設提供了有利的貨源保障。

1996年11月，太倉港被批准為國家一類口岸正式對外國籍船舶開放。

1999年9月，國家海關總署批准太倉港為集裝箱中轉港。

2001年，國家交通部、國家發展計劃委員會把太倉港定位為上海國際航運中心集裝箱運輸的幹線港。

2005年11月，江蘇省委省政府決定成立副廳級建制的中共江蘇太倉港口工作委員會和江蘇太倉港口管理委員會，全面承擔太倉港口建設和發展等管理職能。

2006年9月，交通運輸部出臺《全國沿海港口布局規劃》，將蘇州港（太倉港區、常熟港區、張家港港區）列為全國9大集裝箱幹線港之一。

2010年5月，國務院批覆《長江三角洲地區區域規劃》，太倉港被定位為重點建設的集裝箱幹線港和江海聯運中轉樞紐港。

2012年12月，財政部、國家發改委、交通運輸部共同批覆同意，自2013年1月1日起太倉港作為沿海港口管理，並執行海港行政事業性收費政策。

2013年9月，交通運輸部出臺公告，自2013年11月1日起取消五星旗海輪進出長江太倉港及以下水域強制引航。自此，太倉港全面實現海港化。

2013年10月，交通運輸部、江蘇省人民政府聯合批覆《蘇州港總體規劃（2013－2030年）》，明確蘇州港是中國沿海主要港口和綜合運輸體系的重要樞紐。