菌種是由菌絲體和培養基所組成的，又稱作菌種體，菌種又分為三級，分別為母種（一級種）、原種（二級種）、栽培種（三級，栽培種包括直接用於播種和栽培的瓶裝種和袋裝種），現在大部分的食用菌種植戶都是購買母種和原種，或者栽培種進行製作種植。
母種是直接從菌類的子實體組織或者菇木分離純化培養出的菌絲體，一般一管母種可以接種4至6瓶原種。 原種就是將培養好的母種移植到用木屑，秸稈等配置成的培養基上面繼續培育。採用750毫升的玻璃瓶培養原種，通常情況下，培養30到60天，一瓶原種就可以用於接種栽培種40至60袋。 為了確保購買到優質高產的菌種，購買時應該按照各級菌種的優質標準來進行選購。
母種的選購：①選母種的時候，首先應聞一聞氣味，在菌種瓶的瓶口棉塞處聞一聞，看有沒有發黴的味道和臭味，如果有異味就說明有雜菌汙染，這樣的母種不建議選用。②應該觀察細看瓶內培養基的前端有沒有乾枯收縮的情況，如果出現乾枯收縮並且與瓶壁分離，這樣的母種是不合格的。
合格的母種聞起來無異味，反而有特異的香味，瓶內的培養基前端沒有乾枯收縮與瓶壁分離的情況，菌絲生長濃密粗壯，菌絲前端整齊沒有長短齒狀現象，內無黃色水珠、菌被，出茹試驗中出菇好，出菇量高的母種，方可選用。
原種的選購：①選擇原種的時候，首先要觀察種瓶中的菌絲料有無與瓶壁分離，瓶底有無黃色水。如有分離說明菌種培養的時間過長，菌絲已經老化；瓶底出現黃色的水，說明菌種已經完全老化了，出現這兩種情況的菌種都不合格不建議使用。②觀察菌種瓶內有無不規則的斑塊，若有斑塊，則說明有雜菌感染，不宜購買。如果菌種瓶中的木屑顏色為棕褐色，木屑未分解，說明培養時間過短，像這種情況買回家之後需要繼續培養一段時間才能使用。
合格的原種，例如平菇、香菇、木耳等木腐菌類的菌種（銀耳除外），從外觀上看整個菌種的菌絲體應該是潔白，濃密，粗壯，均勻的，裡面沒有不規則的斑塊，菌絲的培養料外觀看上去呈淡黃色，這才是合格的原菌種。
菌種是由菌絲體和培養基所組成的，又稱作菌種體，菌種又分為三級，分別為母種（一級種）、原種（二級種）、栽培種（三級，栽培種包括直接用於播種和栽培的瓶裝種和袋裝種），現在大部分的食用菌種植戶都是購買母種和原種，或者栽培種進行製作種植。
母種是直接從菌類的子實體組織或者菇木分離純化培養出的菌絲體，一般一管母種可以接種4至6瓶原種。 原種就是將培養好的母種移植到用木屑，秸稈等配置成的培養基上面繼續培育。採用750毫升的玻璃瓶培養原種，通常情況下，培養30到60天，一瓶原種就可以用於接種栽培種40至60袋。 為了確保購買到優質高產的菌種，購買時應該按照各級菌種的優質標準來進行選購。
母種的選購：①選母種的時候，首先應聞一聞氣味，在菌種瓶的瓶口棉塞處聞一聞，看有沒有發黴的味道和臭味，如果有異味就說明有雜菌汙染，這樣的母種不建議選用。②應該觀察細看瓶內培養基的前端有沒有乾枯收縮的情況，如果出現乾枯收縮並且與瓶壁分離，這樣的母種是不合格的。
合格的母種聞起來無異味，反而有特異的香味，瓶內的培養基前端沒有乾枯收縮與瓶壁分離的情況，菌絲生長濃密粗壯，菌絲前端整齊沒有長短齒狀現象，內無黃色水珠、菌被，出茹試驗中出菇好，出菇量高的母種，方可選用。
原種的選購：①選擇原種的時候，首先要觀察種瓶中的菌絲料有無與瓶壁分離，瓶底有無黃色水。如有分離說明菌種培養的時間過長，菌絲已經老化；瓶底出現黃色的水，說明菌種已經完全老化了，出現這兩種情況的菌種都不合格不建議使用。②觀察菌種瓶內有無不規則的斑塊，若有斑塊，則說明有雜菌感染，不宜購買。如果菌種瓶中的木屑顏色為棕褐色，木屑未分解，說明培養時間過短，像這種情況買回家之後需要繼續培養一段時間才能使用。
合格的原種，例如平菇、香菇、木耳等木腐菌類的菌種（銀耳除外），從外觀上看整個菌種的菌絲體應該是潔白，濃密，粗壯，均勻的，裡面沒有不規則的斑塊，菌絲的培養料外觀看上去呈淡黃色，這才是合格的原菌種。