迄今為止研究發現水蛭素是種強效的凝血酶抑制劑。

水蛭素是水蛭及其唾液腺中提取出來的活性成分之一。水蛭素的活性最顯著，而且相關的研究比較多。水蛭素的作用主要有高效抗凝血、抗血栓形成等。

在臨床上它主要用於預防和治療各種血栓形成，它是多個氨基酸組成的多肽，對凝血酶的抑制作用非常明顯。到目前為止，水蛭素是對凝血酶抑制作用最強的天然物質。由於水蛭素的抗凝血作用非常顯著，在臨床上的應用也越來越廣，主要用於預防和治療各種血栓疾病。可以用於治療急性心血梗死，預防冠狀動脈閉塞，還可以防治動靜脈血栓疾病。水蛭素還可以用於治療ATⅢ缺乏症、血小板減少症。

它和肝素相比安全性比較高，用很小的量就可以發揮作用，不會引起出血。不過對於水蛭素的應用目前還在研究中，不僅可以抗凝化瘀，還可以阻止癌細胞轉移，對骨肉瘤、纖維肉瘤、黑素瘤等都有作用。

當然對它的研究不止於此,現今發現，增生性瘢痕和瘢痕疙瘩形成的原因之一就是成纖維細胞過度增生。所以很多學者把水質素應用到體外培養的成纖維細胞上。發現水蛭素可以讓成纖維細胞細胞分裂週期停滯。所以從這一點上講，它對於增生性瘢痕有治療作用。可是該實驗只停留在實驗室基礎研究階段，還沒有應用到臨床階段，只是一個研究的方向，還不能應用在實體活人身上。