關於申時行，《萬曆十五年》一書中有很詳細的記載。本人認為：申時行是一位老練的政治家，具有敏銳的政治嗅覺。張居正的形象在萬曆皇帝心中崩塌同時導致萬曆皇帝心中的文官形象一落千丈，這時申時行應運而出。他的迂迴思維，多少挽回了張居正銳意革新留下來的一些後遺症，同時慢慢扭轉萬曆皇帝對文官集團的成見。同時他做人處世的哲學也值得我們學習。

在後世多數批評者的眼中，申時行是一個“首鼠兩端”“八面玲瓏”“左右逢源”既無主見，也無能力，更無作為的人，特別是申時行入主文淵閣的這九年時間裡的作為，和張居正大刀闊斧的改革相比，實在是過於平靜，以至於有點波瀾不驚。但是正是有這樣的一種類似潤滑劑作用的人物的出現，才使大明帝國的經濟和民生得以短暫的休養，才能期待以後的發展。

申時行在多達二百九十九人的進士隊伍脫穎而出奪取狀元，然後又因為才幹而被張居正加以重用，他自身的才能是不容置喙的。王世貞給申時行的評價是“富有積蓄，不近懸崖，不樹異幟”也正好說明了申時行謙謹的品性，同時申時行始終秉持道德上的操守，在德行上也可謂是典範。

關於對申時行的“不作為”是眾人認為的詬病，但這也正是申時行的高明之處。其實，在申時行的心中也有一個“萬曆之治”的燦爛理想，但是他有張居正的前車之鑑：像張居正此等“沒有獨裁的地位，卻有獨裁的地位”的人物尚且無法改變這個帝國的弊端，他這樣一個既無“背景”又無“身家”的人何以能做到呢？況且在他看來，此時的大明帝國已經經不起他再次的折騰了。

申時行是一個富有現實感的人，他懂得為臣之道。他清晰地認識到：朝廷最大的任務是促進文官之間的互相信賴與和諧。此亦即鼓舞士氣，發揮精神上的力量。要影響全體文官，申時行必須首先提供自己的誠意。他寧可被目為大和事佬，甚至被批評為犧牲原則的政客，但他堅持他調濟折衷的原則。他確實看透了國家為解決問題而設立文官，但國家的最大問題也就是文官。所以他一再推行他的誠意，目的就是使文官集團之間，使皇帝和文官集團之間具有誠意，只有這樣才能上下一致，才能使得大明帝國得以維持正常的運轉並求得發展。

申時行一生最大的功績就是在萬曆十二年及時將帝國從關於張居正的一切爭論中拉了出來，避免更多的人事動盪，萬曆十二年皇帝精神煥發，但僅僅時隔兩年皇帝就發現自己想做的任何事情都做不了的時候，申時行就洩氣了。雖然申時行也不斷後悔未能讓皇帝成為一個有為的君主，但這是皇帝本身的問題，還有體制的問題，豈非申時行所能掌握。

有明一朝，皇帝和文官就是2個爭鋒相對的群體。

張居正更是激化了這個矛盾，執政期間吊打萬曆，乃至死後被抄家。

鑑於前任，申時行接過政府班子就做了2件事情：

1修復皇帝和文官集團之間的關係，讓帝國平穩執行

2保護自己身後不被清算

在首輔位置上辛苦維持8年，照顧各方利益，最後被迫辭官。

評價：

大廈將傾，沒有力挽狂瀾的能力。只能當個勤勞糊裱匠。心酸與誰訴？