蜜蜂成蟲的主要內部器官包括消化排洩器官、迴圈器官、呼吸器官、生殖器官、神經系統及蜜蜂的腺系統。
消化排洩器官是從口到肛門的一條長的消化管，可分為前腸、中腸和後腸三個部分。中後腸分界處有排洩器官馬氏管。前腸由咽、食道、蜜囊和前胃連線組成。咽起抽吸和反吐液體食物的抽吸泵作用。蜜囊用於貯存和攜帶花蜜。前胃是食物進入中腸的調節器。中腸是蜜蜂的胃，是蜜蜂消化食物和吸收養分的主要器官。後腸由小腸和大腸構成，中腸未被消化的食物經小腸繼續消化吸收，最後進入大腸，所有未被消化吸收的廢物經大腸吸收水分後排出體外。蜜蜂的主要排洩器官有浸浴在血液中的馬氏管、大腸以及部分脂肪體，這些器官主要排洩蜜蜂的代謝廢物、尿酸和尿酸鹽以及食物殘渣。
蜜蜂迴圈系統是開放式的，血液除透過背血管外，直接流到體腔內各部分組織中。背血管後端封閉，分成後部心臟和前部動脈兩部分，前端開口於頭腔腦下。心臟的肌肉壁有節奏地搏動，從而驅使血液向前流動。動脈僅是引導血液向前流動的簡單血管，起輸運血液的作用。蜜蜂血淋巴作為一種迴圈體液在生理上不同於高等動物的血液，無輸氧功能，血淋巴血糖含量較高，含蛋白質、無機鹽和各種酶類。血淋巴的作用主要是輸送營養物質，運走代謝廢物及為某些機體運動提供壓力。
蜜蜂的呼吸系統主要由氣門、氣管、氣囊和微氣管組成。氣門是氣管通向體外的開口。蜜蜂身體每側有10個氣門，3對在胸部，7對在腹部。蜜蜂第1對氣門最大，位於前胸和中胸之間，在前胸背板的側葉下面，並有稠密的長毛保護。氣管緊連著氣囊，氣囊是由支氣管的形式一直分佈到身體的各個部分，包括內部器官和各個附肢，最後形成許多微氣管。微氣管末端分佈到組織細胞內外。微氣管末端充滿液體，能從氣管送來的空氣中吸收氧氣。細胞代謝產生的二氧化碳，大部分排入周圍的血淋巴中，然後透過氣管或體壁的薄膜柔軟部分擴散出去。
蜜蜂的生殖系統由生殖腺和一系列附屬器官組成。其中蜂王和雄蜂是生殖器官發育完全的個體。蜂王的生殖系統由卵巢、輸卵管、受精囊、附性腺和外生殖器組成。雄蜂生殖系統由一對睪丸、兩條輸精管、一對貯精囊、一對黏液腺、一對射精管和陰莖組成。工蜂的生殖器官已明顯退化，卵巢僅具3～8條卵巢管，受精囊僅存痕跡，其他附屬器官也已退化，失去正常的交配生殖機能。
蜜蜂的神經系統由中樞神經、交感神經、周緣神經和遍及全身的感覺器組成，其功能是支配蜜蜂體內各器官與組織的協調一致，使之適應環境變化。中樞神經由腦和腹神經組成，支配著全身的感覺器官和運動中樞。交感神經又稱內臟神經，由位於前腸背面和側面的許多小型神經節及其發出的神經組成。主要支配和調節內臟的正常新陳代謝活動。周緣神經包括除中樞神經和神經節以外的分佈在全身的所有感覺神經纖維和運動神經纖維，以及與之相連的感覺器和反應器，是一個複雜的神經傳導網路。
蜜蜂的腺系統由具有分泌機能的上皮細胞群組成。分為外分泌腺和內分泌腺。外分泌腺一般較大，主要有唾液腺、舌腺、上顎腺、納氏腺、蠟腺、螫針腺等。其中有些腺體對蜜蜂的生活起重要作用。內分泌腺主要有前胸腺、內側體、咽側體等。前胸腺，分泌蛻皮激素，控制幼蟲的蛻皮，幼蟲期咽側體分泌保幼激素，控制幼蟲發育初期蟲態，並影響雌性蜂的級型分化。
蜜蜂成蟲的主要內部器官包括消化排洩器官、迴圈器官、呼吸器官、生殖器官、神經系統及蜜蜂的腺系統。
消化排洩器官是從口到肛門的一條長的消化管，可分為前腸、中腸和後腸三個部分。中後腸分界處有排洩器官馬氏管。前腸由咽、食道、蜜囊和前胃連線組成。咽起抽吸和反吐液體食物的抽吸泵作用。蜜囊用於貯存和攜帶花蜜。前胃是食物進入中腸的調節器。中腸是蜜蜂的胃，是蜜蜂消化食物和吸收養分的主要器官。後腸由小腸和大腸構成，中腸未被消化的食物經小腸繼續消化吸收，最後進入大腸，所有未被消化吸收的廢物經大腸吸收水分後排出體外。蜜蜂的主要排洩器官有浸浴在血液中的馬氏管、大腸以及部分脂肪體，這些器官主要排洩蜜蜂的代謝廢物、尿酸和尿酸鹽以及食物殘渣。
蜜蜂迴圈系統是開放式的，血液除透過背血管外，直接流到體腔內各部分組織中。背血管後端封閉，分成後部心臟和前部動脈兩部分，前端開口於頭腔腦下。心臟的肌肉壁有節奏地搏動，從而驅使血液向前流動。動脈僅是引導血液向前流動的簡單血管，起輸運血液的作用。蜜蜂血淋巴作為一種迴圈體液在生理上不同於高等動物的血液，無輸氧功能，血淋巴血糖含量較高，含蛋白質、無機鹽和各種酶類。血淋巴的作用主要是輸送營養物質，運走代謝廢物及為某些機體運動提供壓力。
蜜蜂的呼吸系統主要由氣門、氣管、氣囊和微氣管組成。氣門是氣管通向體外的開口。蜜蜂身體每側有10個氣門，3對在胸部，7對在腹部。蜜蜂第1對氣門最大，位於前胸和中胸之間，在前胸背板的側葉下面，並有稠密的長毛保護。氣管緊連著氣囊，氣囊是由支氣管的形式一直分佈到身體的各個部分，包括內部器官和各個附肢，最後形成許多微氣管。微氣管末端分佈到組織細胞內外。微氣管末端充滿液體，能從氣管送來的空氣中吸收氧氣。細胞代謝產生的二氧化碳，大部分排入周圍的血淋巴中，然後透過氣管或體壁的薄膜柔軟部分擴散出去。
蜜蜂的生殖系統由生殖腺和一系列附屬器官組成。其中蜂王和雄蜂是生殖器官發育完全的個體。蜂王的生殖系統由卵巢、輸卵管、受精囊、附性腺和外生殖器組成。雄蜂生殖系統由一對睪丸、兩條輸精管、一對貯精囊、一對黏液腺、一對射精管和陰莖組成。工蜂的生殖器官已明顯退化，卵巢僅具3～8條卵巢管，受精囊僅存痕跡，其他附屬器官也已退化，失去正常的交配生殖機能。
蜜蜂的神經系統由中樞神經、交感神經、周緣神經和遍及全身的感覺器組成，其功能是支配蜜蜂體內各器官與組織的協調一致，使之適應環境變化。中樞神經由腦和腹神經組成，支配著全身的感覺器官和運動中樞。交感神經又稱內臟神經，由位於前腸背面和側面的許多小型神經節及其發出的神經組成。主要支配和調節內臟的正常新陳代謝活動。周緣神經包括除中樞神經和神經節以外的分佈在全身的所有感覺神經纖維和運動神經纖維，以及與之相連的感覺器和反應器，是一個複雜的神經傳導網路。
蜜蜂的腺系統由具有分泌機能的上皮細胞群組成。分為外分泌腺和內分泌腺。外分泌腺一般較大，主要有唾液腺、舌腺、上顎腺、納氏腺、蠟腺、螫針腺等。其中有些腺體對蜜蜂的生活起重要作用。內分泌腺主要有前胸腺、內側體、咽側體等。前胸腺，分泌蛻皮激素，控制幼蟲的蛻皮，幼蟲期咽側體分泌保幼激素，控制幼蟲發育初期蟲態，並影響雌性蜂的級型分化。