在有機化合物的命名中，官能團有時作為取代基（詞頭），有時作為母體（詞尾），當官能團作為詞頭，即取代基時，有常見的16種取代基。

1.羧基 ——COOH

2.磺酸基 ——SO3H

3.烴氧羰基 ——COOR

4.甲醯基 ——CHO 亦可稱醛基，而醛是他作為詞尾的名字

5.滷甲醯基 ——COX（F,Cl,Br,I等鹵族元素），由鹵族元素與醛基上的氫取代而來

6.滷代 ——X（同上，鹵族元素）

7.氧代 ——CO，他作為詞尾的叫法是，酮。

8.氨基甲醯基 ——CONH2，甲醯基中的氫被氨基取代

9.氰基 ——CN

10.酚烴基 ——OH，直接與苯上的碳原子相連的稱為，酚羥基

11.醇羥基 ——OH，初上例之外，其餘稱醇羥基

12.氨基 ——NH2

13.烴氧基 ——OR，又稱醚基

14.烴基 ——R

15.硝基 ——NO2

16.亞硝基 ——NO

在系統命名法中，取代基所處的位置。

取代基:即官能團取代母體中的氫所形成的原子或原子團，且和官能團一樣是具有決定有機化合物化學特性的官能團。

舉個例子，假如官能團是寄生物，那麼寄生在母體的時候，需要脫掉母體身上一個氫給自己騰位置，從而形成取代基。

拓展:假如一有機物含有的取代基為羧基，那該有機化合物則具羧酸性質，因此在有機化學中，給有機化合物分類時，有兩種分類方法，一種是按碳架分類，另一種是按官能團分類，把化學性質相近的放一起，便於研究。