形態上成熟的種子萌發前內部進行能導致種子萌發的生理變化。有些果樹的種子必須在完成後熟作用後才能發芽、生長。 大多數落葉果樹的種子是在秋季或深秋季節成熟，臨近冬季惡劣的環境條件下不利於果樹生長，在長期的系統發育過程中，果樹獲得了休眠特性，以此來適應逆境，儲存自身。所以這類果樹的種子，從形態上看，胚、胚乳以及其他部分的構造都是完善的，但因含有阻礙萌發的物質，種子的胚處於深休眠狀態，這樣的種子，即使讓它充分吸水，並置適於發芽的環境中，也不會發芽，必須在一定的條件下，生理上發生一系列變化，完成後熟作用，解除休眠狀態，才能發芽、生長。而大多數常綠果樹的種子沒有後熟過程，種子形態成熟之後，只要環境條件適宜即可萌芽、生長。 後熟中的種子。在較低溫度的作用下，水分由珠孔進入內部，使種皮軟化（仁果類）或種殼脹裂（核果類），通氣得到改善，胚的呼吸強度增大，提高了細胞膜的透性及酶的活性，種胚及下胚軸中抑制胚活動的根皮苷、內種皮中的脫落酸減少；核糖核酸（RNA）及脫氧核糖核酸（DNA）增加；澱粉轉化為糖；蛋白質轉化為可溶性氨基酸；脂肪變為脂肪酸；開始了旺盛的生理活動，種子才能萌芽生長。 果樹種子完成後熟作用要求的條件因樹種而異，有的只需要一定的低溫就可以完成後熟，如核桃。但大多數樹種需要2～7℃的低溫和適宜的溼度，時間的長短因樹種而異（見層積處理）。 生產上常用的促進果樹種子後熟的方法有：

①利用層積處理或低溫存放種子；

②進行秋播（中國溫潤氣候區及冷涼溼潤氣候區）利用自然界冬季的低溫、雨雪，促進種子後熟；