1、種雞場、孵化場
大腸桿菌可因種蛋帶菌而垂直傳播，因此種雞場必須做好種雞群大腸桿菌病的淨化工作，及時發現和淘汰病雞，加強種蛋收集、存放和整個孵化過程的衛生消毒管理。
種蛋產出後2小時內應用藥物燻蒸消毒或用0.3%的過氧乙酸進行帶雞噴霧消毒。淘汰破損或明顯有糞跡汙染的種蛋，搞好孵化車間的環境衛生，對種蛋及孵化裝置進行嚴格消毒，防止經種蛋傳播及初生雛的水平感染是預防大腸桿菌病發生的重要環節。
2、 雞舍衛生良好
加強飼養管理，定期對雞舍及其周圍環境進行消毒是防治大腸桿菌病的有效措施。雞出欄後要對雞舍進行徹底清掃、沖洗、噴灑消毒藥或燻蒸消毒，空欄期間可用2%-5%燒鹼或15%-20%的生石灰水等進行消毒，定期更換消毒藥。對雞場的環境和雞舍定期噴霧消毒，可交替使用葵甲溴銨溶液、雙季銨鹽絡合碘和聚維酮碘等消毒劑。保持雞舍內適宜的溫溼度，防止空氣、飼料及飲水汙染。
3、雞舍空氣狀況良好
合理控制養殖密度，做好通風換氣，降低雞舍內氨氣濃度（氨氣的濃度1-3周應低於10ppm，4周-出欄應低於20ppm），保持雞舍空氣狀況良好，尤其在冬季，注意早、中、晚溫差較大，既要保持通風良好，也要保證雞舍溫度正常。
4、免疫接種
由於大腸桿菌血清型較多，型與型之間不產生交叉免疫，疫苗防治難度大。大腸桿菌苗有多價苗（以油佐劑滅活苗為主）和亞單位滅活苗，為確保菌苗的預防效果，一般需進行兩次免疫。
養殖戶應正確選擇合理的疫苗，避免只追求免疫效果而選擇較強毒株的疫苗。“場內自家苗”（從本場發病雞群中分離菌株，鑑定其血清型後，據此製成的菌苗）的預防效果相對最佳。
實際生產中，採用疫苗廠的標準株防疫大腸桿菌的效果並不理想，所以，很多普通養雞戶和出欄週期較短的肉用商品雞場很少使用該類疫苗，多數是以藥物預防為主。而在目前食品安全監管的高壓態勢下，很多大規模的種禽場和商品蛋禽場等為了最大限度的解決藥物殘留問題，多采用自家苗用於大腸桿菌的預防。
5、飼料和飲水方面
營養全面、均衡，飼料和飲水安全、充足，可以使雞群體質健壯，增強機體抵抗力。飼料的採購、貯存和加工等環節要加強衛生管理，防止發黴、變質，減少大腸桿菌的汙染。對水井、水塔和水箱等儲水設施以及輸水管道要經常清理、適時消毒。
6、全進全出
全進全出的飼養方法是預防該病的有效方法，可有效避免不同日齡、不同批次雞群間的交叉感染。
7、降低應激
在受到應激如斷喙、接種、轉群、冷熱應激等造成雞體抗病力下降時，可在飼料中新增魚肝油或飲水中新增維生素C，也可以使用複合維生素降低雞群應激反應，增強免疫力，預防繼發感染。
8、預防投藥
(1)雛雞開口藥
在實際生產中，對2-６日齡的雛雞進行開口藥預防，能有效控制雛雞大腸桿菌的發生。常用的開口藥有：頭孢噻呋鈉、阿莫西林和恩諾沙星等，如果生產有機產品（如有機土雞、有機土雞蛋等），可以選用白頭翁散或益生菌做開口藥。
(2) 定期投藥預防
在飼養過程中，雖然雞群沒有發病症狀，但部分或大部分雞可能帶菌，一旦受到外界應激就很可能發病，可以採用定期投藥預防。
在傳統養殖觀念的影響下，養殖戶多采用抗生素或化學合成藥物進行預防，存在濫用抗生素和化學藥物的現象。這不僅容易導致細菌的耐藥性問題，也很容易出現藥物殘留，威脅到食品安全。
1、種雞場、孵化場
大腸桿菌可因種蛋帶菌而垂直傳播，因此種雞場必須做好種雞群大腸桿菌病的淨化工作，及時發現和淘汰病雞，加強種蛋收集、存放和整個孵化過程的衛生消毒管理。
種蛋產出後2小時內應用藥物燻蒸消毒或用0.3%的過氧乙酸進行帶雞噴霧消毒。淘汰破損或明顯有糞跡汙染的種蛋，搞好孵化車間的環境衛生，對種蛋及孵化裝置進行嚴格消毒，防止經種蛋傳播及初生雛的水平感染是預防大腸桿菌病發生的重要環節。
2、 雞舍衛生良好
加強飼養管理，定期對雞舍及其周圍環境進行消毒是防治大腸桿菌病的有效措施。雞出欄後要對雞舍進行徹底清掃、沖洗、噴灑消毒藥或燻蒸消毒，空欄期間可用2%-5%燒鹼或15%-20%的生石灰水等進行消毒，定期更換消毒藥。對雞場的環境和雞舍定期噴霧消毒，可交替使用葵甲溴銨溶液、雙季銨鹽絡合碘和聚維酮碘等消毒劑。保持雞舍內適宜的溫溼度，防止空氣、飼料及飲水汙染。
3、雞舍空氣狀況良好
合理控制養殖密度，做好通風換氣，降低雞舍內氨氣濃度（氨氣的濃度1-3周應低於10ppm，4周-出欄應低於20ppm），保持雞舍空氣狀況良好，尤其在冬季，注意早、中、晚溫差較大，既要保持通風良好，也要保證雞舍溫度正常。
4、免疫接種
由於大腸桿菌血清型較多，型與型之間不產生交叉免疫，疫苗防治難度大。大腸桿菌苗有多價苗（以油佐劑滅活苗為主）和亞單位滅活苗，為確保菌苗的預防效果，一般需進行兩次免疫。
養殖戶應正確選擇合理的疫苗，避免只追求免疫效果而選擇較強毒株的疫苗。“場內自家苗”（從本場發病雞群中分離菌株，鑑定其血清型後，據此製成的菌苗）的預防效果相對最佳。
實際生產中，採用疫苗廠的標準株防疫大腸桿菌的效果並不理想，所以，很多普通養雞戶和出欄週期較短的肉用商品雞場很少使用該類疫苗，多數是以藥物預防為主。而在目前食品安全監管的高壓態勢下，很多大規模的種禽場和商品蛋禽場等為了最大限度的解決藥物殘留問題，多采用自家苗用於大腸桿菌的預防。
5、飼料和飲水方面
營養全面、均衡，飼料和飲水安全、充足，可以使雞群體質健壯，增強機體抵抗力。飼料的採購、貯存和加工等環節要加強衛生管理，防止發黴、變質，減少大腸桿菌的汙染。對水井、水塔和水箱等儲水設施以及輸水管道要經常清理、適時消毒。
6、全進全出
全進全出的飼養方法是預防該病的有效方法，可有效避免不同日齡、不同批次雞群間的交叉感染。
7、降低應激
在受到應激如斷喙、接種、轉群、冷熱應激等造成雞體抗病力下降時，可在飼料中新增魚肝油或飲水中新增維生素C，也可以使用複合維生素降低雞群應激反應，增強免疫力，預防繼發感染。
8、預防投藥
(1)雛雞開口藥
在實際生產中，對2-６日齡的雛雞進行開口藥預防，能有效控制雛雞大腸桿菌的發生。常用的開口藥有：頭孢噻呋鈉、阿莫西林和恩諾沙星等，如果生產有機產品（如有機土雞、有機土雞蛋等），可以選用白頭翁散或益生菌做開口藥。
(2) 定期投藥預防
在飼養過程中，雖然雞群沒有發病症狀，但部分或大部分雞可能帶菌，一旦受到外界應激就很可能發病，可以採用定期投藥預防。
在傳統養殖觀念的影響下，養殖戶多采用抗生素或化學合成藥物進行預防，存在濫用抗生素和化學藥物的現象。這不僅容易導致細菌的耐藥性問題，也很容易出現藥物殘留，威脅到食品安全。