明太祖朱元璋天縱奇才，出身於布衣，開國之後創立了一系列制度。清承明制，從朝廷體制到基層組織，各個環節層層疊加、互稱系統、迴圈運作，基本上建構了一個高效率、嚴密性的鄉村控制結構，可以說在古代社會背景下，都有很多創新性的設計。

其中，屯田制、裡甲制、保甲制、魚鱗圖冊制、黃冊制等基層制度建設，是朱元璋針對基層民眾一套完整嚴密的管理模式，促進動員效率，其實也是建立在耕戰一體的思維模式之下。所謂賦役黃冊為戶籍登記與記錄簿冊，魚鱗圖冊就是耕地登記與清理圖冊。其中，黃冊一式四份，分別呈報戶部、布政司、府、縣各存一份。各省布政使司在往戶口上報時，都用黃紙裝裱，故而叫做黃冊。

朝廷和各級官府大致按照總圖治天下，編戶齊民，賦稅科差一目瞭然。依賴裡甲為基層組織，是魚鱗圖冊和黃冊實施的前提。每裡110戶，分為10甲，採取十甲輪流應役制排年見年。同時，基層村落設里老人之職規勸調解民眾，基層職役統計形成黃冊底籍、草冊及抄底，遞報官府。這些裡甲雜役：

里長對上級官府負責，管束所屬人戶，統計本里人戶丁產的消長變化，監督人戶生產事宜，調理裡內民刑糾紛。

明洪武十四年（1381年），朱元璋為了明確全國土地，保障財政收入，藉此核實戶口、清算賦稅、徵調賦役，製作了圖籍清冊。故而，朱元璋命得力人手雷厲風行，在原有的戶帖制度上建立了黃冊制度，把兩淮和兩浙的一些商人的土地和資產納入朝廷賦稅系統，試圖均平賦稅，規劃徭役：

第一，規定以戶為單位，戶部總攬全域性，地方官府主導，裡甲職役負責必須詳細登載各個村落、集鎮、城市民眾的鄉貫、姓名、年齡、丁口、田宅、資產等要素。並根據從事的職業，劃定各種歸屬的戶籍，大致分為民、軍、匠三大類。 第二，戶帖表冊發給各戶，必須由本人填寫，或本戶自報請人代寫，杜絕徇私舞弊。如有人隱瞞作弊，家長處死，家屬流放化外。第三，每戶表格首著戶籍，登載戶等、姓名，及所編裡甲、應役年份與具體職役，世代相承，永當此役，不可改變。軍籍、匠籍不許分戶，防止分丁析戶規避差徭，也不得隨意變亂版籍，因此賦役黃冊實為一種變相的世襲制度。第四，當然，官紳等級、庶民等級和賤民等級的要求具體細化。裡甲具體分為正管戶和畸零戶，以丁糧多寡為序，分豁上、中、下三等人戶，帶管畸零附於圖後。冊首總為一圖，登載該圖田土和稅糧總數。第五，各級圖表列舊管、新收、開除、實在四大專案，使用四柱式統計法，正收、轉收、正除、轉除清楚劃分，職業不同，役種不一，實施裡甲正役、雜泛差役和均徭三軌制，使得散居商人也是不能逃避徭役。

地方官府掌握魚鱗分冊，朝廷掌握魚鱗總冊，黃冊在魚鱗圖冊和裡甲登記上詳細統計戶口人丁，相互參照，構成了朝廷徵收賦稅和管理民眾的基礎。到了朱元璋晚年，要求魚鱗圖冊每年更新，黃冊為十年一大造。明朝270多年時間，全國各地總共繪造了27次黃冊。中國歷史上的基層行政組織和區劃的地域差異性極大，幾乎達到因縣而異，但朱元璋卻透過制度統一起來。

為了有效運作，朝廷在南直隸、浙江、湖廣、江西、福建等土地較多的省份，還陸續建立了糧長制度，加強了對民眾的控制和專制集權的形成。從清代到民國時期，戶部黃冊制度也延續了下來。