2003年挪威科學家（之前與曾邦哲也有關於遺傳學概念的通訊）稱之為整合遺傳學（integrative genetics）並建立了研究中心，2005年，國際上Cambien F.和 Laurence T.發表動脈硬化研究的系統遺傳學（system genetics）觀點，Morahan G., Williams RW.等於2007年（Bock G., Goode J.編輯）論述系統遺傳學將成為下一代遺傳學發展。2005-2008年，國際系統遺傳學研究迅速發展， 歐美國家建立了許多系統遺傳學研究中心和實驗室。2008年美國國立衛生研究院（NIH）設立腫瘤的系統遺傳學研究專項基金。2008年3月美國加州舉辦了整合與系統遺傳學會議，2009年10月荷蘭召開了系統遺傳學研討會。

系統遺傳學發展的歷史：人類在新石器時代就已經馴養動物和栽培植物，而後人們逐漸學會了改良動植物品種的方法。西班牙學者科盧梅拉在公元60年左右所寫的《論農作物》一書中描述了嫁接技術，還記載了幾個小麥品種。

533～544年間中國學者賈思勰在所著《齊民要術》一書中論述了各種農作物、蔬菜、果樹、竹木的栽培和家畜的飼養，還特別記載了果樹的嫁接，樹苗的繁殖，家禽、家畜的閹割等技術。改良品種的活動從那時以後從未中斷。

許多人在這些活動的基礎上力圖闡明親代和雜交子代的性狀之間的遺傳規律都未獲成功。直到1866年奧地利學者孟德爾根據他的豌豆雜交實驗結果發表了《植物雜交試驗》的論文，揭示了現在稱為孟德爾定律的遺傳規律，才奠定了遺傳學的基礎。