用於閉證神昏。麝香辛溫，氣極香，走竄之性甚烈，有極強的開竅通閉醒神作用，為醒神回蘇之要藥，最宜閉證神昏，無論寒閉、熱閉，用之皆效。治療溫病熱陷心包，痰熱矇蔽心竅，小兒驚風及中風痰厥等熱閉神昏，常配伍牛黃、冰片、硃砂等藥，組成涼開之劑；用治中風卒昏，中惡胸腹滿痛等寒濁或痰溼阻閉氣機，矇蔽神明之寒閉神昏，常配伍蘇合香、檀香、安息香等藥，組成溫開之劑。

用於瘡瘍腫毒，咽喉腫痛，該品辛香行散，有良好的活血散結，消腫止痛作用，內服，外用均有良效。用治瘡瘍腫毒，常與雄黃、乳香、沒藥同用，即醒消丸，或與牛黃、乳香、沒藥同用；用治咽喉腫痛，可與牛黃、蟾酥、珍珠等配伍，如六神丸。

用於難產，死胎，胞衣不下。該品活血通經，有催生下胎之效。常與肉桂為散，如《張氏醫通》香桂散；亦有以麝香與豬牙皂、天花粉同用，蔥汁為丸。外用取效，如《河北醫藥集錦》墮胎丸。

用於血瘀經閉，徵瘕，心腹暴痛，跌打損傷，風寒溼痺等證。該品辛香，開通走竄，可行血中之瘀滯，開經絡之壅遏，以通經散結止痛每週一次，2週一療程，療效滿意；用治痺證疼痛，頑固不愈者，可與獨活、威靈仙、桑寄生等祛風溼藥同用。

開竅醒神，活血通經，止痛，催產。具有開竅醒神，活血散結，止痛消腫，催生下胎的功效。主治熱病神昏，中風痰厥，氣鬱暴厥，中惡昏迷，血瘀經閉，痛經，積聚，心腹暴痛，風溼痺痛，跌打損傷，癰疽惡瘡，喉痺，口瘡，牙疳 ，蟲蛇咬傷，難產，死胎，胞衣不下。

麝香是一種昂貴藥材，運用於多種疾病，且常有急救作用，例如突然昏厥（寒閉神昏）所使用的蘇合香丸，常用麝香配伍蘇合香、安息香、檀香等藥材組成溫開之劑。麝香還可用於血瘀、閉經等證，活血通經。