工程變更的處理流程是：1、建設單位須對原工程設計進行變更，發包方應不遲於變更前14天以書面形式向承包方發出變更通知，變更超過原設計標準或批准的建設規模時，須經原規劃管理部門和其他有關部門審查批准，並由原設計單位提供變更的相應圖紙和說明。①、因變更導致的合同價款的增減及造成的承包方損失，由發包方承擔，延誤的工期相應順延。②、合同履行中發包方要求變更工程質量標準及發生其他實質性變更，由雙方協商解決。2、承包商要求對原工程進行變更，控制順序：①、施工中乙方不得擅自對原工程設計進行變更。否則因此發生的費用和導致甲方的直接損失，由乙方承擔，延誤的工期不予順延。②、乙方在施工中提出的合理化建議涉及設計圖紙或施工組織設計的變更及對原材料、裝置的換用，須經工程師同意。未經同意擅自更改或換用，乙方承擔由此發生的費用，並賠償甲方的有關損失，延誤的工期不予順延。③、工程師同意採用乙方的合理化建議，鬚髮生的費用和獲得的收益，甲乙雙方另行約定分擔或分享。工程變更程式：在變更前，雙方就辦理工程變更中涉及的費用增加和造成損失的補償協議，以免因費用補償的爭議影響工程進度。變更是指承包人根據監理簽發設計檔案及監理變更指令進行的、在合同工作範圍內各種型別的變更，包括合同工作內容的增減、合同工程量的變化、因地質原因引起的設計更改、根據實際情況引起的結構物尺寸、標高的更改、合同外的任何工作等。所謂工程變更，在工程專案實施過程中，按照合同約定的程式，監理人根據工程需要，下達指令對招標檔案中的原設計或經監理人批准的施工方案進行的在材料、工藝、功能、功效、尺寸、技術指標、工程數量及施工方法等任一方面的改變，統稱為工程變更。

工程變更的流程如下：提出工程變更申請報告。填報變更原因、相關圖紙和變更工程量和造價等。監理公司稽核工程變更必要性和可行性，稽核工程變更造價合理性，稽核工程變更對工期的影響，並簽署稽核意見;設計單位稽核工程變更圖紙稽核相關圖紙是否滿足設計規範，是否符合原設計要求，並簽署稽核意見。建設單位按相關規定的審批許可權進行申報或批覆。建設單位專案主管按上級領導批覆意見向監理公司出具工程變更審批意見，明確變更是否執行。監理公司下發工程變更通知令，在變更通知中明確變更工程專案的詳細內容、變更工程量、變更專案的施工技術要求、質量標準、相關圖紙，明確變更工程的預算造價和工期影響。承包商按工程變更通知令執行工程變更，如承包商對工程變更持有異義，承包商也應遵照執行，並在7天內向監理公司提交爭議，協商解決。

發現設計方案有所不利或不能施工或有其他原因，發現方提出交予業主方，業主方提交變更要求交設計，這是設計變更的依據。施工變更，由施工方發現的事，書面提出（簽證單）經監理確認，業方方認可後執行。