《放學後》《秘密》《白夜行》《暗戀》《信》《嫌疑人X的獻身》《畢業——雪月花殺人遊戲》《白馬山莊殺人事件》《學生街裡的殺人事件》
《11文字的殺人》
《浪花少年偵探團》
《以眨眼乾杯》
《魔球》
《殺人現場在雲端》
《沉睡的森林》
《布魯特斯的心臟——完全犯罪殺人接力》
《十字豪宅的小丑》
《鳥人計劃》（入圍第11屆吉川英治文學新人獎）
《宿命》*（2004年拍攝日劇SP，柏原崇、藤木直人主演）
《沒有犯人的殺人夜晚》
《偵探俱樂部》
《面具山莊殺人事件》
《變身》（2005年拍攝電影，玉木宏、蒼井優主演）
《迴廊亭殺人事件》
《天使之耳
《雪地殺機》
《美麗的兇器》
《同班的同學》
《分身》
《和阿忍老師說再見——浪花少年偵探團·獨立篇
《過去我死去的家》
《操縱彩虹的少年》
《怪人們》
《天空之蜂》》（入圍第17屆吉川英治文學新人獎）
《平行世界的愛的故事》
《怪笑小說》
《那個時候我們是傻瓜》（散文集）
《誰殺了她》
《名偵探的守則》（2009春季日劇，松田翔太主演）
《名偵探的詛縛》
《毒笑小說》
《惡意》*（1996年拍攝日劇，佐佐木藏之介主演）
《秘密》*（第52屆日本推理作家協會獎、第120屆直木獎入圍）（1998年拍攝電影，廣末涼子主演）
《偵探伽利略》*（2007年拍攝日劇，福山雅治、柴崎幸主演）
《我殺了他》
《白夜行》*（第122屆直木獎入圍）（2006年拍攝日劇，山田孝之、綾瀨遙主演）
《預知夢》*（2007年拍攝日劇，福山雅治、柴崎幸主演）
《再一個謊言》
《超·殺人事件》*（「2003年世界奇妙物語春季篇」拍攝其中一個單元故事，西村雅彥、大冢寧寧主演）
《單戀》*（第125屆直木獎入圍）
《湖邊兇殺案》*（2002年拍攝電影，藥師丸博子、豐川悅司、役所廣司主演）
《時生》（2004年拍攝日劇，櫻井翔主演，劇名為「給父親的口信」）
《綁架遊戲》*（2003年拍攝電影、藤木直人、仲間由
《殺人之門》*
《信件》*（第129屆直木獎入圍）（2005年拍攝電影，山田孝之、澤尻繪里香主演）
《幻夜》*（第131屆直木獎入圍）
《挑戰》（散文集）
《彷徨的刀刃》
《黑笑小說》
《嫌疑犯X的獻身》*（第134屆直木獎、第6屆本格推理小說大獎）（2008年拍攝電影，福山雅治、柴崎幸、堤真一、松雪泰子主演）
《科學》（散文集）
《夢迴杜林》（散文集）
《紅色手指》
《使命與靈魂極限》
《拂曉之街》
《瀕死之眼》
《也許是最後的寒暄》（散文集）
《流星之絆》（2008年拍攝日劇，錦戶亮、戶田惠梨香、二宮和也主演）
《伽利略的苦惱》
《聖女的救濟》
《悖論13》
《放學後》《秘密》《白夜行》《暗戀》《信》《嫌疑人X的獻身》《畢業——雪月花殺人遊戲》《白馬山莊殺人事件》《學生街裡的殺人事件》
《11文字的殺人》
《浪花少年偵探團》
《以眨眼乾杯》
《魔球》
《殺人現場在雲端》
《沉睡的森林》
《布魯特斯的心臟——完全犯罪殺人接力》
《十字豪宅的小丑》
《鳥人計劃》（入圍第11屆吉川英治文學新人獎）
《宿命》*（2004年拍攝日劇SP，柏原崇、藤木直人主演）
《沒有犯人的殺人夜晚》
《偵探俱樂部》
《面具山莊殺人事件》
《變身》（2005年拍攝電影，玉木宏、蒼井優主演）
《迴廊亭殺人事件》
《天使之耳
《雪地殺機》
《美麗的兇器》
《同班的同學》
《分身》
《和阿忍老師說再見——浪花少年偵探團·獨立篇
《過去我死去的家》
《操縱彩虹的少年》
《怪人們》
《天空之蜂》》（入圍第17屆吉川英治文學新人獎）
《平行世界的愛的故事》
《怪笑小說》
《那個時候我們是傻瓜》（散文集）
《誰殺了她》
《名偵探的守則》（2009春季日劇，松田翔太主演）
《名偵探的詛縛》
《毒笑小說》
《惡意》*（1996年拍攝日劇，佐佐木藏之介主演）
《秘密》*（第52屆日本推理作家協會獎、第120屆直木獎入圍）（1998年拍攝電影，廣末涼子主演）
《偵探伽利略》*（2007年拍攝日劇，福山雅治、柴崎幸主演）
《我殺了他》
《白夜行》*（第122屆直木獎入圍）（2006年拍攝日劇，山田孝之、綾瀨遙主演）
《預知夢》*（2007年拍攝日劇，福山雅治、柴崎幸主演）
《再一個謊言》
《超·殺人事件》*（「2003年世界奇妙物語春季篇」拍攝其中一個單元故事，西村雅彥、大冢寧寧主演）
《單戀》*（第125屆直木獎入圍）
《湖邊兇殺案》*（2002年拍攝電影，藥師丸博子、豐川悅司、役所廣司主演）
《時生》（2004年拍攝日劇，櫻井翔主演，劇名為「給父親的口信」）
《綁架遊戲》*（2003年拍攝電影、藤木直人、仲間由
《殺人之門》*
《信件》*（第129屆直木獎入圍）（2005年拍攝電影，山田孝之、澤尻繪里香主演）
《幻夜》*（第131屆直木獎入圍）
《挑戰》（散文集）
《彷徨的刀刃》
《黑笑小說》
《嫌疑犯X的獻身》*（第134屆直木獎、第6屆本格推理小說大獎）（2008年拍攝電影，福山雅治、柴崎幸、堤真一、松雪泰子主演）
《科學》（散文集）
《夢迴杜林》（散文集）
《紅色手指》
《使命與靈魂極限》
《拂曉之街》
《瀕死之眼》
《也許是最後的寒暄》（散文集）
《流星之絆》（2008年拍攝日劇，錦戶亮、戶田惠梨香、二宮和也主演）
《伽利略的苦惱》
《聖女的救濟》
《悖論13》