權責發生制優點：可以正確反映各個會計期間所實現的收入和為實現收入所應負擔的費用，從而可以把各期的收入與其相關的費用、成本相配合，加以比較，正確確定各期的收益。 收付實現制優點：收付實現制會計基礎在證明現金支出符合性控制合規方面具有獨特的功效。收付實現制反映企業實實在在擁有的現金，而企業能否按期償還債務、支付利息、分派股利等很大程度上取決於企業所實際擁有的現金。 此外，收付實現制操作簡單，需要的會計技術較少，易於被使用者理解，資料處理成本比較低廉。 權責發生制缺點：用權責發生制確定企業的收入、費用及利潤時，費用必須依其同收入的關係分攤到各個會計期間，就必須採用折舊方法、攤銷方法和存貨計價方法等人為的方法，使會計中採用了許多的估計、預測資料，從而其提供的資料也較收付實現制喪失了一定的客觀性和可比性。 收付實現制缺點：

1、不利於單位進行成本核算、提高效率和績效考核；

2、不能全面準確記錄和反映單位的負債情況，不利於防範財務風險；

3、收支專案不配比，不能真實反映當年收支結餘；

4、不能真實反映對外投資業務；

5、不能反映固定資產的真實價值和隱性負債問題；

6、不利於處理政府採購業務和年終結轉等會計事宜。