在《合金彈頭2》的劇情中，玩家在叛軍的幫助下勉強擊敗了火星人。然而火星人本來可以直接綁走摩登將軍然後全身而退的，但是他們卻偏偏釋放了摩登將軍，並假裝撤離地球。似乎這其中還有什麼不可告人的秘密吧！
沒錯，這一切都是火星人的陰謀，他們的假意撤退促成了人類表面上的勝利。實際上真正的摩登將軍並沒有被釋放，救回來的僅僅是火星人假扮的摩登將軍。這在《合金彈頭3》最終關中才得以揭曉。然而在這期間，假摩登利用身份製造了多起慘案，其中就包括了變異生物的培育和火星生物的移植。
第一關的垃圾島進行了多次的核爆實驗後，大型的生物都死了，只有那些躲在暗處的爬行動物和少數的魚類逃過了一劫，但是卻因為核輻射的原因發生了變異，變成了體型巨大的生物。
因此第一關我們一出場就能看到遍地的死魚，和部分未完全爆炸的核武器。
這些巨大的生物被叛軍利用了起來，在這些巨型生物身上安裝了各種裝甲和火力，成為麾下重要的戰鬥戰鬥單位。
其中已經有不少的寄居蟹被馴化了，一關BOSS在被馴化之後加入了炮臺，擁有強大的破壞能力。在一關關底追殺玩家很久。玩家稍微慢一點就有可能被它擊殺。
然而因為受到的輻射程度不同，出現了大量品種不一的巨型螃蟹，其中Ohumein-Conga成為了精英怪，而Chowmein-Conga成為了小怪。在合金彈頭系列中一般的小兵都是一槍一個，但是這群怪物需要打很久才死，要是拼刀的話玩家有可能會甘拜下風。
Ohumein-Conga
Chowmein-Conga
另一邊，玩家們要是走水下路線的話就會發現大量正在被馴化的海鰻。它們以水母為食，根本無視這群水母是否帶電。這是遊戲中玩家唯一不能消滅的怪物，玩家無論是用什麼火力打在它的身上都不會起作用。雖然攻擊它會出現攻擊的效果，但是不會加分，也不會受傷。
有意思的是，這群鰻魚在被套上枷鎖之後，叛軍還給它們取了名字，分別是：Helen、 Linda、 Jenny 、 Barbie（海倫、琳達、珍妮、芭比），沒想到叛軍們也都有一顆少女心啊！就連海鰻的名字都是這麼可愛。
這些水母被輻射之後，竟然進化出了蓄電的功能，玩家一旦靠近就會被電死。而水母的體型也增大了不少，或許正是這個原因才能成為海鰻的食物吧！體積太小的話不夠塞牙縫。
在後期的版本中，這些水母已經進化出飛行能力，甚至可以在空中呆很久。
這並非是核汙染後的產物，而是叛軍的科學實驗失敗後的成果。
在叛軍隱藏的實驗室中，科學家向植物中注射了帶有毒素基因的化學物質，直接導致了這些植物的異變，成為能夠移動的生命體。在實驗失敗之後，叛軍紛紛撤離了這裡。因此我們在第四關的時候會看到大量的叛軍逃走的場面。
食人花的生命力極為頑強，不僅僅是抗擊打能力強，而且在死之後還會留下種子方便自己再次復活。而這些種子一旦被生物接觸就會寄生，並吸收養分。玩家要是中招就會破腸而出
更加恐怖的是，在《合金彈頭7》中出現了食人花的母體。看來食人花的能力又得到了進化。
之前的食人花都是直接將人類吃點，而食人花的母體可以輕鬆的將人類抓起來，然後將衣服脫乾淨了再享用。
比較奇怪的是蝗蟲為什麼在爆炸中並沒有死亡。或許是某個角落中殘存的了那麼幾隻吧！
而這些倖存的蟲子變異之後再也不吃植物了，成為可怕的食肉動物。蝗蟲進化之後，可以在天空一直飛翔不落地。玩家一旦不慎，就有可能被抓到天上去啃咬而死。
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在《合金彈頭2》的劇情中，玩家在叛軍的幫助下勉強擊敗了火星人。然而火星人本來可以直接綁走摩登將軍然後全身而退的，但是他們卻偏偏釋放了摩登將軍，並假裝撤離地球。似乎這其中還有什麼不可告人的秘密吧！
沒錯，這一切都是火星人的陰謀，他們的假意撤退促成了人類表面上的勝利。實際上真正的摩登將軍並沒有被釋放，救回來的僅僅是火星人假扮的摩登將軍。這在《合金彈頭3》最終關中才得以揭曉。然而在這期間，假摩登利用身份製造了多起慘案，其中就包括了變異生物的培育和火星生物的移植。
第一關的垃圾島進行了多次的核爆實驗後，大型的生物都死了，只有那些躲在暗處的爬行動物和少數的魚類逃過了一劫，但是卻因為核輻射的原因發生了變異，變成了體型巨大的生物。
因此第一關我們一出場就能看到遍地的死魚，和部分未完全爆炸的核武器。
這些巨大的生物被叛軍利用了起來，在這些巨型生物身上安裝了各種裝甲和火力，成為麾下重要的戰鬥戰鬥單位。
其中已經有不少的寄居蟹被馴化了，一關BOSS在被馴化之後加入了炮臺，擁有強大的破壞能力。在一關關底追殺玩家很久。玩家稍微慢一點就有可能被它擊殺。
然而因為受到的輻射程度不同，出現了大量品種不一的巨型螃蟹，其中Ohumein-Conga成為了精英怪，而Chowmein-Conga成為了小怪。在合金彈頭系列中一般的小兵都是一槍一個，但是這群怪物需要打很久才死，要是拼刀的話玩家有可能會甘拜下風。
Huge HermitOhumein-Conga
Chowmein-Conga
Enormous Moray另一邊，玩家們要是走水下路線的話就會發現大量正在被馴化的海鰻。它們以水母為食，根本無視這群水母是否帶電。這是遊戲中玩家唯一不能消滅的怪物，玩家無論是用什麼火力打在它的身上都不會起作用。雖然攻擊它會出現攻擊的效果，但是不會加分，也不會受傷。
有意思的是，這群鰻魚在被套上枷鎖之後，叛軍還給它們取了名字，分別是：Helen、 Linda、 Jenny 、 Barbie（海倫、琳達、珍妮、芭比），沒想到叛軍們也都有一顆少女心啊！就連海鰻的名字都是這麼可愛。
Jellyfish這些水母被輻射之後，竟然進化出了蓄電的功能，玩家一旦靠近就會被電死。而水母的體型也增大了不少，或許正是這個原因才能成為海鰻的食物吧！體積太小的話不夠塞牙縫。
在後期的版本中，這些水母已經進化出飛行能力，甚至可以在空中呆很久。
食人花這並非是核汙染後的產物，而是叛軍的科學實驗失敗後的成果。
在叛軍隱藏的實驗室中，科學家向植物中注射了帶有毒素基因的化學物質，直接導致了這些植物的異變，成為能夠移動的生命體。在實驗失敗之後，叛軍紛紛撤離了這裡。因此我們在第四關的時候會看到大量的叛軍逃走的場面。
食人花的生命力極為頑強，不僅僅是抗擊打能力強，而且在死之後還會留下種子方便自己再次復活。而這些種子一旦被生物接觸就會寄生，並吸收養分。玩家要是中招就會破腸而出
更加恐怖的是，在《合金彈頭7》中出現了食人花的母體。看來食人花的能力又得到了進化。
之前的食人花都是直接將人類吃點，而食人花的母體可以輕鬆的將人類抓起來，然後將衣服脫乾淨了再享用。
蝗蟲比較奇怪的是蝗蟲為什麼在爆炸中並沒有死亡。或許是某個角落中殘存的了那麼幾隻吧！
而這些倖存的蟲子變異之後再也不吃植物了，成為可怕的食肉動物。蝗蟲進化之後，可以在天空一直飛翔不落地。玩家一旦不慎，就有可能被抓到天上去啃咬而死。
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