本能寺之變以後，織田信長、織田信忠父子命喪黃泉，明智光秀的作戰計劃成功。然而，在擊殺了信長父子以後，明智光秀明顯面對著更強大的威脅——織田家各地的軍團與家臣，還有織田信雄、織田信孝兄弟倆，織田家的家臣完全可以擁戴他們為主君討伐明智光秀。
果然，原本準備出征四國的四國軍團停留在了京畿，在西國的羽柴秀吉率軍返回京畿以後，兩軍會師，一同攻打背叛織田信長的明智光秀。明智光秀的兵力僅萬人左右，而織田軍則有明智軍的三到四倍之多，這場戰毫無懸念地贏了。
然而，明智光秀被討伐，只是織田信長父子死後織田家所需要做的第一件事，在這之後，織田家就需要處理織田信長的龐大遺產了。在這樣的情況下，織田家的家臣們在清州城召開了會議，參與者有織田信雄、織田信孝、羽柴秀吉、柴田勝家、丹羽長秀、池田恆興、堀秀政。
最終，與會者決定，織田家的家督由織田信長的孫子、織田信忠的兒子三法師繼承，織田信雄、織田信孝作為三法師的陣代，代行家督職權。織田信雄原本的領地在伊勢國南部，清州會議後又增加了尾張國一國（原本是織田信忠的領地）。按照織田信長的安排，織田信孝的領地原本應該是在四國的贊岐國（討伐長宗我部後），但是因為本能寺之變的緣故，四國征伐沒有實現，於是在他原本的伊勢國神戶的領地的基礎上，把織田信忠的美濃國封了織田信孝。
柴田勝家則除了原本的領國越前國以外，加封近江國三郡，羽柴秀吉在播磨國的基礎上，加封了山城國、河內國，羽柴秀吉的養子羽柴秀勝因為也是織田信長的兒子的緣故，受封了丹波國，因而羽柴家的勢力分佈到了京畿與西國。丹羽長秀和池田恆興的領地同上面的相比，加封的就不算很多了。
值得一提的是，在本能寺之變前幾個月，織田家將武田家滅亡。可是在本能寺之變以後，織田家在關東的家臣瀧川一益被逐出關東，甲斐、信濃等武田家舊領也爆發了一揆，將織田家在當地的家臣或殺或逐。在這時，北條氏政以武田信玄的女婿身份為名義，想要奪取武田家的舊領，於是清州會議後，織田家就下令讓德川家康奪下武田家遺領，以免被敵人奪取（本能寺之變後，原本臣服的北條家叛變）。
本能寺之變以後，織田信長、織田信忠父子命喪黃泉，明智光秀的作戰計劃成功。然而，在擊殺了信長父子以後，明智光秀明顯面對著更強大的威脅——織田家各地的軍團與家臣，還有織田信雄、織田信孝兄弟倆，織田家的家臣完全可以擁戴他們為主君討伐明智光秀。
果然，原本準備出征四國的四國軍團停留在了京畿，在西國的羽柴秀吉率軍返回京畿以後，兩軍會師，一同攻打背叛織田信長的明智光秀。明智光秀的兵力僅萬人左右，而織田軍則有明智軍的三到四倍之多，這場戰毫無懸念地贏了。
然而，明智光秀被討伐，只是織田信長父子死後織田家所需要做的第一件事，在這之後，織田家就需要處理織田信長的龐大遺產了。在這樣的情況下，織田家的家臣們在清州城召開了會議，參與者有織田信雄、織田信孝、羽柴秀吉、柴田勝家、丹羽長秀、池田恆興、堀秀政。
最終，與會者決定，織田家的家督由織田信長的孫子、織田信忠的兒子三法師繼承，織田信雄、織田信孝作為三法師的陣代，代行家督職權。織田信雄原本的領地在伊勢國南部，清州會議後又增加了尾張國一國（原本是織田信忠的領地）。按照織田信長的安排，織田信孝的領地原本應該是在四國的贊岐國（討伐長宗我部後），但是因為本能寺之變的緣故，四國征伐沒有實現，於是在他原本的伊勢國神戶的領地的基礎上，把織田信忠的美濃國封了織田信孝。
柴田勝家則除了原本的領國越前國以外，加封近江國三郡，羽柴秀吉在播磨國的基礎上，加封了山城國、河內國，羽柴秀吉的養子羽柴秀勝因為也是織田信長的兒子的緣故，受封了丹波國，因而羽柴家的勢力分佈到了京畿與西國。丹羽長秀和池田恆興的領地同上面的相比，加封的就不算很多了。
值得一提的是，在本能寺之變前幾個月，織田家將武田家滅亡。可是在本能寺之變以後，織田家在關東的家臣瀧川一益被逐出關東，甲斐、信濃等武田家舊領也爆發了一揆，將織田家在當地的家臣或殺或逐。在這時，北條氏政以武田信玄的女婿身份為名義，想要奪取武田家的舊領，於是清州會議後，織田家就下令讓德川家康奪下武田家遺領，以免被敵人奪取（本能寺之變後，原本臣服的北條家叛變）。