綜合自然地理
著重對自然地理環境整體特徵——自然景觀進行系統綜合研究，是自然地理學的重要分支學科。它包括綜合自然區劃研究、土地型別研究和自然綜合過程研究等幾部分。
綜合自然區劃研究的特點是按地域分異規律對地球表層進行區域系統的劃分，劃分出的地域單元是彼此不重複出現的；土地型別研究的特點是按地段分異規律進行型別系統的劃分，劃分出的型別單元在地表是重複出現的；自然綜合過程研究包括現代物理過程（熱量水分平衡）、化學過程（化學元素遷移與平衡）、生物過程（生物地理群落與生態平衡）和時間過程（古地理過程）等。現代地理過程的綜合結果展現了自然地理環境的現代特徵，古地理過程的綜合結果是自然地理的古環境。現代自然地理環境是古地理環境演替的結果與延續。
部門自然地理
是從自然地理各組成要素角度進行研究，闡明各要素的型別、特徵、過程和與其它要素相互作用關係與結果的學科。主要包括地貌學、氣候學、水文地理學、土壤地理學、植物區系與植物地理學、動物地理學、化學地理學、醫學地理學、海洋地理學等學科。
區域自然地理學
是研究某一特定地區的自然地理要素之間的相互關係和自然地理環境的特徵、結構、發展變化的學科，也是區域地理學的分支學科。
古地理學
是研究和重建地質時期地球表面自然地理現象的學科。
歷史自然地理學
是研究近一萬年來人類歷史時期自然地理環境的變化及其規律的學科，也是歷史地理學的分支學科。
其他
另外，有普通自然地理學，它是研究自然地理環境的物質組成、結構特徵形成和變化規律的學科，也有人認為它是綜合自然地理學的分支學科。部門性的分支學科有地貌學、氣候學、水文地理學，土壤地理學、生物地理學、冰川學、凍土學、化學地理學和醫學地理學等。
地貌學、氣候學、水文地理學、土壤地理學、生物地理學是在研究自然地理環境整體的基礎上以自然地理環境的某一成分為研究物件，研究其組成、結構、動態及分佈等特徵和規律。它們的形成與某些自然科學有關，是自然地理學與相鄰的其他科學的邊緣學科。
地貌學又稱地形學，是研究地球表面的形態特徵、成因、分佈及其演變規律的學科，是自然地理學與地質學的邊緣學科。
氣候學是研究氣候特徵、形成、分佈和演變規律，以及氣候與其他自然因子和人類活動的關係的學科，是自然地理學與大氣科學的邊緣學科。
水文地理學，研究地球表面各類水體的性質、形態特徵變化與時程分配，以及分佈規律的學科，是自然地理學與水文學的邊緣學科。土壤地理學是研究土壤與地理環境的關係的學科，是自然地理學與土壤學的邊緣學科。
自然地理
植物地理學是研究植被空間分佈規律的學科，是自然地理學與植物學的邊緣學科。
動物地理學是研究動物在地璋表面的分佈及其生態地理規律的學科，是自然地理學與動物學的邊緣學科。
以獨特的自然綜合體或自然地理環境的某一方面為研究物件的分支學科有：
冰川學是研究地球表面各種自然冰體的形成、特徵、發育及其分佈規律的學科。
凍土學是研究凍土的形成、特徵、發育及其分佈規律的學科。
化學地理學是研究地理環境的化學組成和化學元素的分佈、遷移轉化規律的學科，是自然地理學與化學的邊緣學科。
醫學地理學是研究人群疾病和健康狀況的地理分佈、與地理環境的關係，以及醫療保健機構和設施地域合理配置的學科。它既是地理學與醫學的邊緣學科，也是應用地理學的分支學科。
此外，還有環境地理學、海洋地理學、荒漠學、河流學、沼澤學等分支學科。
現代自然地理學不斷加強定量分析、生態化和應用研究的同時，還注意吸收其他學科的新成就和研究方法，開始進行地理預測研究，並將更加重視全球環境問題。同時，自然地理學研究與人文地理學研究將越來越緊密的聯絡在一起
綜合自然地理
著重對自然地理環境整體特徵——自然景觀進行系統綜合研究，是自然地理學的重要分支學科。它包括綜合自然區劃研究、土地型別研究和自然綜合過程研究等幾部分。
綜合自然區劃研究的特點是按地域分異規律對地球表層進行區域系統的劃分，劃分出的地域單元是彼此不重複出現的；土地型別研究的特點是按地段分異規律進行型別系統的劃分，劃分出的型別單元在地表是重複出現的；自然綜合過程研究包括現代物理過程（熱量水分平衡）、化學過程（化學元素遷移與平衡）、生物過程（生物地理群落與生態平衡）和時間過程（古地理過程）等。現代地理過程的綜合結果展現了自然地理環境的現代特徵，古地理過程的綜合結果是自然地理的古環境。現代自然地理環境是古地理環境演替的結果與延續。
部門自然地理
是從自然地理各組成要素角度進行研究，闡明各要素的型別、特徵、過程和與其它要素相互作用關係與結果的學科。主要包括地貌學、氣候學、水文地理學、土壤地理學、植物區系與植物地理學、動物地理學、化學地理學、醫學地理學、海洋地理學等學科。
區域自然地理學
是研究某一特定地區的自然地理要素之間的相互關係和自然地理環境的特徵、結構、發展變化的學科，也是區域地理學的分支學科。
古地理學
是研究和重建地質時期地球表面自然地理現象的學科。
歷史自然地理學
是研究近一萬年來人類歷史時期自然地理環境的變化及其規律的學科，也是歷史地理學的分支學科。
其他
另外，有普通自然地理學，它是研究自然地理環境的物質組成、結構特徵形成和變化規律的學科，也有人認為它是綜合自然地理學的分支學科。部門性的分支學科有地貌學、氣候學、水文地理學，土壤地理學、生物地理學、冰川學、凍土學、化學地理學和醫學地理學等。
地貌學、氣候學、水文地理學、土壤地理學、生物地理學是在研究自然地理環境整體的基礎上以自然地理環境的某一成分為研究物件，研究其組成、結構、動態及分佈等特徵和規律。它們的形成與某些自然科學有關，是自然地理學與相鄰的其他科學的邊緣學科。
地貌學又稱地形學，是研究地球表面的形態特徵、成因、分佈及其演變規律的學科，是自然地理學與地質學的邊緣學科。
氣候學是研究氣候特徵、形成、分佈和演變規律，以及氣候與其他自然因子和人類活動的關係的學科，是自然地理學與大氣科學的邊緣學科。
水文地理學，研究地球表面各類水體的性質、形態特徵變化與時程分配，以及分佈規律的學科，是自然地理學與水文學的邊緣學科。土壤地理學是研究土壤與地理環境的關係的學科，是自然地理學與土壤學的邊緣學科。
自然地理
植物地理學是研究植被空間分佈規律的學科，是自然地理學與植物學的邊緣學科。
動物地理學是研究動物在地璋表面的分佈及其生態地理規律的學科，是自然地理學與動物學的邊緣學科。
以獨特的自然綜合體或自然地理環境的某一方面為研究物件的分支學科有：
冰川學是研究地球表面各種自然冰體的形成、特徵、發育及其分佈規律的學科。
凍土學是研究凍土的形成、特徵、發育及其分佈規律的學科。
化學地理學是研究地理環境的化學組成和化學元素的分佈、遷移轉化規律的學科，是自然地理學與化學的邊緣學科。
醫學地理學是研究人群疾病和健康狀況的地理分佈、與地理環境的關係，以及醫療保健機構和設施地域合理配置的學科。它既是地理學與醫學的邊緣學科，也是應用地理學的分支學科。
此外，還有環境地理學、海洋地理學、荒漠學、河流學、沼澤學等分支學科。
現代自然地理學不斷加強定量分析、生態化和應用研究的同時，還注意吸收其他學科的新成就和研究方法，開始進行地理預測研究，並將更加重視全球環境問題。同時，自然地理學研究與人文地理學研究將越來越緊密的聯絡在一起