開啟口袋妖怪，不斷按Z鍵，檢視遊戲介紹。用移動四鍵和Z鍵選中字母，確定玩家名稱。

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對於勁敵，可以取新名字，也可以取系統名。進入遊戲，玩家需要換睡衣睡覺。

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做了美夢後，起床出發，去找博士，在博士家會被勁敵挑釁一波。

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跟博士交流，三隻夢中的寶可夢都已被選走。再去找博士，得到一隻皮卡丘，得到新手物品，開始冒險

1、我們見到的是今次黑白的舞臺伊修地方的博士，アララギ博士。

2、她向我們介紹了PM是什麼，和前作沒什麼兩樣，是和我們一起戰鬥一起遊玩的生物。

3、之後，就輪到選擇我們的主角了。有男女兩種選擇，之後便是設定名字，輸入完畢後，會介紹本作的兩位勁敵，貝魯(女)和切雷恩(男)。之後便正式進入遊戲。

4、一開始主角在房間裡，兩位勁敵會走進來。之後會和主角說起關於博士送的禮物的事。禮物上的信寫著，從三隻PM中選擇一隻!之後開啟禮物。

5、這裡筆者選擇了火豬。

6、隨後兩位勁敵也選擇了PM，好戰的貝魯主動要求與主角對戰。她使用的是被主角選擇的初始PM剋制的那隻。

7、無論戰鬥勝負，因為精靈對戰，房間裡亂得不成樣子，然後切雷恩幫助主角和貝魯的PM回覆HP。

8、之後與切雷恩對戰，他使用的PM是剋制主角選擇的初始PM的那隻。

9、戰鬥後(勝利得到500)因為媽媽的呼喊，兩位勁敵下樓，跟著下樓吧。

10、原來樓下的媽媽聽到了精靈對戰的聲音，便喊三人下來，之後三人才想起去研究所的事情。兩位勁敵走後，媽媽會幫主角的精靈回覆體力。

11、之後得到影片功能!然後離開自己家。

12、從自己家出來後看到貝魯急匆匆的離開。去貝魯的家(左邊)，一進去就看到貝魯對自己父親表示要成為偉大的精靈訓練師。

13、之後往博士的研究所進發，看到門口立著的兩位勁敵，和切雷恩說話，一起進去見博士。

14、進去後博士向三人打招呼，正要自我介紹的時候，切雷恩卻說出了她的名字，博士大囧。。之後她重新介紹了自己，是為了研究精靈誕生和起源的博士。

15、隨後，她說PM是值得信賴的一起戰鬥的夥伴，並且問你要不要給初始PM取名字。

16、接著她說到了PM圖鑑，對此貝魯表示疑惑不解，博士做出瞭解釋。PM圖鑑是能自動記錄遇到的PM資料的道具。主角等三人要為了精靈圖鑑的完成而踏上冒險之旅。

17、在此之後，博士會說要教大家遭遇野生PM的方法，要大家來1號道路等她，之後離開了研究所。兩位勁敵為之後如何冒險議論紛紛。

18、離開博士的研究所，兩位勁敵也會一起出來。主角的媽媽正在門口等著主角，她會讚賞主角接受了博士完成PM圖鑑的願望。

19、之後媽媽鼓勵主角在伊修地方盡情地冒險，便離開了。兩位勁敵也去1號道路找博士了。

20、往右，再往上去鎮子，和兩位勁敵一起去1號道路。

21、博士會在那等著，告訴眾人PM圖鑑會自動記錄遇到的PM，如果能捕獲PM能得到更詳細的資訊。之後便是一場演示的捕捉精靈的過程。

22、隨後主角得到5個精靈球，博士離開。兩位勁敵發下了競爭宣言後也跟著離開了。

23、之後往上走，到下一個城市前面。兩位勁敵就在那等著你，問你抓住了多少PM。不過，數目並不影響什麼劇情。然後博士用影片功能叫大家去精靈中心。

24、進入下一個城市，到精靈中心門口，發現兩位勁敵正等著你。進去後博士在裡面，會介紹精靈中心的功能，之後和上面的喬伊小姐說話恢復PM的HP。

25、然後是介紹左邊的儲存PM的電腦，以及右下的道具店。

26、整備完畢後，出門往左，和切雷恩對話，會發現左邊有個老怪人在一群怪人的簇擁下來發表演講。那個老怪人自稱是等離子團的，說了一堆關於如何對待PM的話，之後就走了。

27、主角和勁敵才不會被他洗腦呢，但是這時候就跑過來一個被洗腦的人，他的名字叫N。他會說PM根本不需要精靈球來束縛行動，和主角展開對戰。使用PM為Lv7的No.015.打敗他後他很失望地離開了。從左邊離開鎮子吧。