馮國璋是老袁手下實力派的軍頭，坐鎮南京，風光旡限，但在袁世凱稱帝問題的表態上得罪了老袁，不在倚以為重。而段祺瑞得罪袁更為直接毫旡掩飾，但老袁卻不敢妄動老段，老段是身邊貼心的實力派，皖系軍人己成系統，馮國璋心知肚明，自己是個主和派，偏安一隅對抗不了中央，爭不過老段。雖然以後直皖戰爭直系勝過皖系，但直系不再是由馮國璋領軍了，而是後起之秀曹錕吳佩孚。

袁世凱沒死之前，段祺瑞已經在北方有了很深的根基，袁世凱後期已經無法壓制段祺瑞，想免徐樹錚的陸軍次長，段祺瑞不同意，大頭都不能擅自做主。袁大頭死後，無兵無權的黎元洪怎麼能是老段的對手。當時山東（張懷芝）、陝西（陳樹藩）、甘肅（張廣建）、浙江（楊善德）、福建（李厚基）、上海（盧永祥）、安徽（接替張勳的倪嗣沖）、湖南（南北戰爭侵入湖南的張敬堯）都是皖系地盤，東三省的張作霖、山西的閻錫山也都向老段輸誠，直隸將軍曹錕也一度加入到皖系陣營，所以老段可以輕輕鬆鬆組建督軍團逼宮。馮國璋一直坐鎮南京，為江蘇將軍，為加大影響力，聯合江西將軍李純、湖北將軍王佔元結盟，稱長江三督。兩者實力對比一眼便知。袁大頭死後，馮國璋也是遙領副總統之職，不敢入京。張勳復辟後，黎元洪不願復任總統，馮國璋只好入京接任大總統，而且只帶了一個師的人馬北上。在北京，馮國璋如龍入淺灘，根本無法制約老段。馮國璋當總統這兩年是極度鬱悶的，到任之後死活不再續任，結果由徐樹錚操縱安福國會選出徐世昌當傀儡。

皖系外厲內荏，真到了直皖大戰時，被吳佩孚幾天給打敗了，皖系漸漸退出歷史舞臺。

也沒鬥過，雖然在軍事上馮國璋比段祺瑞厲害，但在政治上段祺瑞比馮國璋厲害。雖然馮國璋成功鎮壓武漢革命軍，但段祺瑞在袁世凱結束清朝政府成功上位上卻起了關鍵作用，這也是為什麼袁世凱選接班人只有段祺瑞能入其法眼的原因。雖然後期馮國璋和段祺瑞鬥法時，馮國璋擼過段祺瑞一把，但後來又不得不把段祺瑞請回來，天真的想和段祺瑞分權管天下，但最終玩不過段祺瑞找了個藉口想回江蘇老巢，沒成想被段祺瑞一個指示，被安徽督軍堵在蚌埠，沒法只好又回到北京。你說誰更厲害呢！

馮國璋一樣鬥不過段祺瑞，被壓制的死死的。

袁世凱死後，黎元洪出任大總統一職，而段祺瑞則擔任了國務總理。當然，北洋政府時期誰有軍隊誰有實權，段祺瑞利用北洋系的支援把握了實權，沒有軍隊的黎元洪空有虛名。最後黎元洪更是因為和段祺瑞鬧矛盾，被他藉著張勳復辟的機會趕下了臺。

黎元洪下臺以後，段祺瑞請副總統馮國璋繼任大總統一職。和黎元洪不同的是，此時馮國璋不僅自己兼任江蘇督軍，手下有部隊，而且他也出身北洋，在北洋系內部也有一定號召力。而江西督軍李純、湖北督軍王佔元更是和他組成了聯盟，不是黎元洪這種軟柿子可以相比的。

所以馮國璋對出任大總統很有興趣，為了保證自己上臺以後還能和段祺瑞有抗衡的力量，他還特意提出了三個條件：

一、江西督軍李純接替自己擔任江蘇督軍。

二、任命自己舊部陳光遠替代李純出任江西督軍。

三、自己進京需要從江蘇抽調陸軍第16師隨行，擔任衛隊，另外他曾經統領過的駐紮北京的陸軍第15師也要劃給他管理。

馮國璋提出這三個條件，是因為深知此時不管當什麼官，沒部隊支援是不行的。他在地方上依靠李純、陳光遠、王佔元外援，而在北京也有兩個師的部隊作為後盾，以便和段祺瑞抗衡。

然而段祺瑞的影響力還是超過了馮國璋的預料，段祺瑞透過拉攏直隸督軍曹錕，很快就把馮國璋壓制的死死的，一樣淪為一個橡皮圖章，他唯一能做的事就是在段祺瑞派人送來的公文上蓋章。有時候馮國璋蓋章前想看一下公文內容，段祺瑞的心腹徐樹錚都會呵斥他，馮國璋這個大總統當的也是很憋屈。

馮國璋當然不願意就當這麼一個空頭總統，所以多次聯合李純、陳光遠、王佔元阻撓段祺瑞以武力解決西南地方軍閥的主張。然而段祺瑞卻在張作霖等人的支援下，始終保持上風。

最後馮國璋南逃，想返回南京，結果走到蚌埠卻被安徽督軍倪嗣沖帶部隊攔截，在倪嗣沖的武力威脅下，馮國璋只能老老實實返回北京。而幫助馮國璋的陸建章，也被徐樹錚公然槍殺。在段祺瑞的步步緊逼下，馮國璋最後只能服軟，老老實實俯首聽命。

所以馮國璋雖然有部隊的支援，但是畢竟實力不如段祺瑞，加上又沒有全力一搏的魄力，所以和黎元洪一樣，老老實實當傀儡。