吉姆是一個住在海邊小鎮的十歲男孩。一天，一個奇怪的船長來到了他的酒店。像是在躲什麼人。過了幾周，那些要找船長的人來了，他們不懷好意，對船長下了“黑色通牒”。但船長在他們走後就意外地死去了，只留下一隻大箱子，裡面裝著許多錢和一個黃布包。吉姆開啟那個包一看，原來是海盜弗林特的寶藏的藏寶圖。就這樣，吉姆決定和李維西醫生、居勞尼先生、史萊德船長和一批船員出發去尋寶。船上一共有26人。

可是沒想到，船上混入了同樣想得到寶藏的海盜。一天，吉姆躲在蘋果桶裡，聽到了西爾巴、漢斯、迪克等幾個海盜的陰謀：他們計劃在找到財寶後返航時動手。吉姆迅速將這些告訴了史萊德船長等人。形勢十分不利，可以確定的不與海盜勾結的人只有七個。

大家終於來到了埋藏寶藏的島上。史萊德船長計劃讓西爾巴等人下船，自己和李維西醫生、居勞尼先生便可控制大船。但吉姆也不小心下了船，在島上目睹西爾巴殺死了兩個可信任、忠誠的船員。吉姆撒腿就跑，遇到一個叫“班”的人。他原先也為福林特做事，但後來被放逐了，在島上獨自生活了三年。他知道寶藏在哪兒。可這時，遠處的戰鬥打響了。

李維西醫生等人放棄了大船，退到島上的木碉堡抵禦海盜的進攻。在戰鬥中他們消滅了不少海盜，但居勞尼先生的三個僕人也不幸犧牲了。這時吉姆也來到了木碉堡。但吉姆的冒險心和突然出現的鬼主意又驅使他溜了出去，偷偷靠近了大船，並割斷了錨繩，讓大船漂到了遠處，此時留在船上的海盜只有漢斯一人了，他試圖攻擊吉姆，但未能得逞。吉姆將大船開到了島的另一邊，可一上岸就被西爾巴抓住了。海盜帶著吉姆來到了寶藏埋藏地點，但只有一個空空如也的大坑。原來都早已被班那去了。海盜們對西爾巴越來越不滿，這時李維西醫生等人有趕到了，消滅了所有海盜。

吉姆帶著寶藏回到了英國。他不但得到了一部分寶藏，也收穫了一次奇妙的歷險