洪秀全領導的太平軍，拒絕清朝的剃髮易服，堅持留長髮，故被清朝廷稱為“長毛賊”、“長毛”、“發賊”、“發逆”，又因為太平軍起家時，大多兩廣人士參加，廣東稱為“粵”，所以又汙稱太平軍為粵匪。全稱為“長毛粵匪”。曾國藩曾作《討粵匪檄》，恭親王奕訢曾作《欽定剿平粵匪方略》，皆對太平軍以粵匪稱呼。

對一支部隊的稱呼，看站在什麼立場上稱呼。清朝廷極端仇視太平天國運動，自然稱太平軍為長毛粵匪，恨不得千刀凌遲而後快；而維新派站在救國的角度，對太平軍雖持負面印象，但稱呼上和緩了許多，比如梁啟超將太平天國的忠王李秀成與大清中堂李鴻章並稱“二李”，並對太平天國的一些英雄們大加讚揚。至於革命黨人，對太平軍則基本持正面印象，將之稱為太平天國運動、太平天國革命、太平天國農民起義等。孫中山將洪秀全與朱元璋對比，將洪稱為反清第一英雄，自稱洪秀全第二。民國建立後，則透過立法禁止汙衊太平軍，1929年透過《禁止誣衊太平天國案》，將太平天國運動稱為“民族解放運動”。

新中國建立後，太平天國運動基本上被看做是正面的運動，“長毛粵匪”的稱呼再也看不到了。歷來的農民起義都被正面評價，太平天國是清朝最大的農民運動，包括後來的義和團都被正面評價。

洪秀全的部隊被叫做“匪”，是可以理解的。因為他最終奪取全國政權失敗，俗話說成者為王敗者為寇，他被稱為匪沒有問題，而且從事實來看，他和他的部隊，很大程度上也確實有很重的匪氣。問題在於“匪”之前，還有“長毛”和“粵”兩個修飾語。這兩個修飾語從何而來呢？當然不是太平天國自家制造，而是大清國對他們的一種蔑稱。當然，諸如此類的蔑稱很多，譬如“賊、髮匪、長毛、粵匪”等等。

這裡有個關鍵詞，那就是“長毛”！大家都知道大清國是辮子國，所有人都留著一根長長的辮子，外人稱之為豬尾巴，而大清國視為天朝的規矩。相比之下，太平軍就割去了這根豬尾巴，開始蓄髮留長髮，也就是所謂的“長毛”。

大清多爾袞那個時代，頒下留髮不留頭的血腥指令，而太平軍的法令則針鋒相對，基本上可以說是留辮不留頭。當然，太平軍也需要和清軍佔領區域做點小生意，那麼來往的人怎麼辦呢？戴假辮子或是假髮是個選擇，卻風險很大（一旦被發現就是死路），所以必須有另一個選擇，那就是太平軍頒發的“剃頭憑，生意人交錢後可以領到證明，“合法”剃頭。

而如果腦袋上生了蝨子長了瘡，非要剃髮又如何呢？太平天國也有專門法令，來自東王楊秀清的諭令：“果系因瘡因蝨，只要館長去保，盡皆釋放”——可見長毛也是講人道的。

至於太平軍本身，有些人需要打入清軍統治區做內應的，那就更不用說了。太平軍中“別有老短毛一類，平時薙髮與恆人等。其乖巧者為彼心腹，出作偵探；其強壯有力者假充官兵，隨營溷入。”他們通常會扮成民間武裝或是官兵，混入清軍一方，尋找機會。（太平軍標語：長毛殺妖多多殺）事實上，太平軍自己並不介意被稱作“長毛”，他們每佔領一個地方，都在要教老百姓一些歌謠，有點像後來盛行的革命歌謠，譬如：“長毛一來，生活好過”這種，通俗易懂，誰都聽得明白。

至於粵匪，事實上太平天國最早起義的地方，是廣西桂平縣金田村，應該叫”桂匪“才對哈。可是大清國一查洪秀全的檔案，原來是考過科舉的廣東花縣（今廣州市花都區）人，所以最終便定性為廣東人在廣西發動的暴動，於是定名為”粵匪“。隨後曾國藩曾發表《討粵匪檄》一文，說太平軍：“舉中國數千年禮義人倫詩書典則，一旦掃地蕩盡。此豈獨我大清之變，乃開闢以來名教之奇變。”

由此，“長髮粵匪”成為大清國對太平軍的統一稱呼，直至孫中山領導下的反清運動興起，方將太平天國稱為“革命”，稱洪秀全為“反清第一英雄”，並自詡為“洪秀全第二”。而北洋軍閥則繼續清朝的貶洪觀點，直至1929年，南京國民政府通過了《禁止誣衊太平天國案》，規定將太平天國為“民族解放運動”，不得使用“長毛髮匪”之類的稱呼；以後的出版物上不得攻擊太平天國，清朝和北洋時期攻擊太平天國的資料則全部被查禁。由此，長毛粵匪一詞漸漸退出歷史舞臺，太平天國成為我們對這一運動的正確稱呼。雖然如此，並不代表我們就認可太平天國，整體而言，所謂天國運動，是舊式權力爭鬥而不是現代意義上的革命。