1、溫水沖服

益生菌的最佳生長溫度和人類腸道正常溫度相近，所以它怕燙，益生菌大多不耐高溫，超過40度時活性便會不可逆的降低。所以沖服益生菌的水溫為35-40攝氏度，否則便會降低或殺死益生菌的活性，並且與熱飲熱食需隔開30分鐘服用。

2、半小時內服用

益生菌厭氧，益生菌很是個很較弱的菌，經不起等待，一旦衝好就儘快服用，不然會被空氣中的氧氣“幹掉”，所以在它們“陣亡”前，要趕緊吃下去，否則它對人體就失去了有益效果。同時益生菌對胃酸也是特別敏感,空腹時和食物消化初期都不適宜服用益生菌,餐後服用益生菌至少要等待30分鐘至1小時。

3、避開抗生素

抗生素是個好壞不分的傢伙，殺死有害菌的同時，也會順道殺死益生菌，所以在服用了抗生素時，須等2-3小時後，再服用益生菌。此時補充益生菌，不僅能維持腸道菌群平衡，還能降低抗生素對身體產生的一些副作用，例如因抗生素而出現的腸炎性腹瀉等。

4、剖宮產寶寶更需要

早產、剖宮產和不是母乳餵養的寶寶不能從媽媽那得到足夠的益生元，為了腸道菌群正常化，應適量補充益生菌。

5、選對菌種很重要

想要獲得益生菌的效果，選擇適合的益生菌非常重要。針對華人腸道健康要求甄選的嗜酸乳桿菌和雙歧桿菌，是兩種人體內最重要的益生菌，也是目前最常見、最安全的菌種，能有效調節菌種平衡，給寶寶補充益生菌一定要認準菌種。