《隱形守護者》除了精緻的場景演出，更為人稱道的則是遊戲的多線結局。每個不同選擇組出不同結局，亦是遊戲的核心所在。

首先，扶桑安魂曲使主角肖途去了日本，這也就背離了他執行潛伏任務的初衷。老師的死，對方敏的虧欠，都也無力償還。更重要的是，扶桑安魂曲還設計了親手殺死純子的橋段。甚至為了掩蓋純子的身份，不惜給純子毀容。

下面，筆者簡要說說開啟扶桑安魂曲結局的選項。

淺野詢問你能否幫忙除掉武藤時，選擇答應。因為要在此刻懂得什麼叫識時務，如果選擇拒絕將會被淺野折磨而死。

將淺野計劃告訴武藤後，武藤會擺脫你刺殺淺野，選擇答應。而後開始刺殺計劃，先是陸望舒而後是淺野，便可開啟扶桑線。之後的選擇就簡單多了，遇到純子後選擇趕緊離開，之後劇情選擇刺向純子，扶桑安魂曲結局展開。

正如前文所言，扶桑線並非完美結局。除了主角肖途真正背棄信仰外，一些主要角色也都命運悲慘。純子成了純子醬，陸望舒還沒說出真實身份就結束了，而肖途也會在原子彈的烈焰中灰飛煙滅。

你真是個魔鬼，這麼想砸死純子?很簡單，只要武藤不殺你，你後面就可以去找武藤出賣淺野，武藤會讓你刺殺淺野，你答應他，順便把正妻幹掉，然後將不得不逃亡日本，這就可以了。後面的隨便你自由選擇。

簡單來說就是，武藤讓你刺殺淺野，你答應他。就開啟了。