商鞅變法處在一個新舊歷史交替時期，新舊勢力鬥爭異常激烈的歷史特點和變法的階級屬性使變法不可避免帶有一定的侷限性。變法輕視教化，鼓吹輕罪重罰。變法在一定程度上加重了廣大人民所受的剝削與壓迫。變法也未與舊制度、文化、習俗徹底劃清界限。具體表現在：1.商鞅變法時，廢除了世親世祿制，侵害了貴族利益，樹敵眾多，加劇了變法阻力。2.商鞅是法家思想的集大成者，他踐行的是嚴刑峻法，所以加重了百姓的壓迫和負擔，加劇了階級矛盾。3.他推行二十等爵制，使得國內盛行尚武風尚，人人崇尚武力，不求學習，只求能在戰場上殺敵。4他推行“燔詩書而明法令”，使得大量文化典籍消失，造成文化的一次大災難。5建立什伍制，使得人人變得功利，鄰里之間常常為了自身利益而舉報他人。 可以說，商鞅變法的作用使得秦國能夠統一中國，也因其歷史侷限性導致秦朝二世而亡。

歷史侷限性：

⑴輕視教化，輕罪重罰：加重剝削壓迫：如：刑法嚴酷。連坐法。

⑵改革不完全徹底：如：按爵位等級佔有田宅和奴隸、公開承認佔有奴隸的合法性。

⑶重農抑商政策，壓制工商業發展，違背社會經濟發展的規律，阻礙商品經濟的發展和社會的進步。

⑷文化高壓政策不利於思想文化發展，摧殘了文化，加強專制統治：導致民族創新意識窒息。