發生於清朝乾隆前期的大小和卓叛亂是一場由新疆回部霍集佔兄弟發動的旨在分裂新疆的民族分裂運動。大、小和卓兄弟之所以發動叛亂，既是由於其個人稱霸野心作祟，也是因為清朝在平定準格爾後派駐新疆各地的官員橫徵暴斂，激化了民族矛盾所致，同時新疆地區長期以來的一直存在的民族分裂勢力也助長了大小和卓兄弟的野心。

一、大、小和卓兄弟個人野心作祟：

清政府於乾隆二十年平定準格爾後，將被準格爾達瓦齊囚禁的大小和卓兄弟釋放，但是不久新疆地區又發生了阿睦爾撒納叛亂，被釋放的和卓兄弟趁亂乘機控制了喀什噶爾、葉爾羌等廣大南疆地區。妄圖趁機割據一方，擺脫清廷統治，建立獨立的伊斯蘭政權。與此同時，清政府派駐南疆地區的各級官員被大小和卓兄弟接連抓獲並殺害，和卓兄弟此舉，已經是與清政府公開撕破了臉，其分裂南疆、割據一方的野心昭然若揭。

二、清政府駐疆官員橫徵暴斂，激化矛盾：

大小和卓兄弟之所以在叛亂初期能夠迅速地佔領南疆各個主要城池，主要是因為清政府派駐於此的各級官員長期以來不得民心，這些官員普遍貪汙腐敗，對當地百姓橫徵暴斂，導致了當地民族矛盾和階級矛盾異常激化，以至於大小和卓兄弟在舉旗叛亂伊始得到了當地回部民眾的廣發支援。

三、中央政府長期沒有對新疆進行有效管理：

清政府雖然從康熙時期就開始著手解決新疆問題，但是由於新疆地區地域閉塞，距離清政府統治核心地區十分遙遠，並且，當地的各族居民與廣大滿、漢民族語言文化截然不同，以至於自康熙年間開始到乾隆初期的新疆問題一直沒有得到有效解決。新疆長期以來遊離於中央政府的有效管轄之外，致使其內部存在了一股民族分裂、民族獨立的勢力、大小和卓兄弟和後來道光年間的張格爾都是這股勢力的代表。

四、沙皇俄國策動支援新疆反動勢力：

沙皇俄國自清朝康熙年間就已經開始了領土東擴的過程，在擴張領土的過程中，沙皇俄國與清王朝發生了多次邊境武裝衝突，由於此時的沙皇俄國還殘存著濃厚的的落後的奴隸制度，而清政府正處於康雍乾的國力全盛時期，所以總之而言雙方打平，雖然沙皇俄國在與清政府的武裝衝突中沒佔到便宜，但是沙俄一直覬覦中國新疆地區，由於不能直接出兵佔領，所以沙皇俄國就選擇策動並支援新疆各股分裂勢力大搞分裂運動。

大小和卓兄弟在叛清自立後由於殘暴統治不得人心而被清軍迅速平定，和卓兄弟在兵敗後狼狽西逃的過程中被部將所殺，其首級被獻與乾隆帝，清政府也因為和卓兄弟的叛亂而調整了對新疆的統治政策，並對回部的制度進行了有限度的改革，從而緩和了矛盾，鞏固了統治。

一、大小和卓兄弟的分裂活動，打著所謂民族獨立的幌子，實際上對內卻殘殺虐待廣大維吾爾族人民，以至於喪失了民心，違背歷史的發展趨勢，維吾爾等族人民因此支援清軍的鬥爭。