工程承包方式主要有施工承包方式和設計施工一體化承包方式兩類。

第一類，施工承包方式。工程設計和施工分離，分別由不同主體負責實施。工程承包人按照招標人提供的設計圖紙和技術規範施工。專案實施通常劃分為一個或若干單項、單位工程合同單元承包，相應的工程責任和風險由一個或若干承包人承擔。該承包方式由各承包人分別向招標人負責，承包人可以將部分非主體和非關鍵工程分包給有相應資質條件的分包人承擔，並由承包人和分包人對分包工程共同承擔連帶責任。該承包方式適用於發包人希望較深入地介入設計控制及對設計和施工分別協調管理並分散承擔風險的情形。該承包方式的建設週期一般較長，責任較難界定，設計和施工間的管理協調工作比較複雜，容易發生糾紛，工程質量、進度、造價控制較難。但是，該承包方式運用簡單、成熟，對承包雙方的專業素質要求不高，且發包人對工程設計和施工各階段實施的控制影響力較大、風險分散。

第二類，設計施工一體化工程承包方式。這類承包方式典型模式有：“設計+施工”、“設計採購製造”及“工廠裝置與設計+施工”等。這類工程承包方式一般適用於工程建設專案規模大、專業技術性強、管理協調工作複雜、發包人對設計施工的管理力量薄弱，且願意將大部分工作內容交給同一承包人的情況。按照設計施工一體化工程承包方式要求，工程承包人應該根據招標人的要求同時負責工程設計和施工。設計施工一體化工程承包方式與施工承包方式最大區別是招標人不再提供工程設計圖紙，只提供基本工程方案（初步）設計/工藝方案設計作為招標條件，而將此後的工程設計與施工責任及相應風險轉移給一個總承包人。這種工程承包方式有利於工程設計與施工之間的銜接配合，可以避免相互脫節而引起差錯、遺漏、變更、返工及糾紛。可以合理組織分段設計與施工，縮短工程建設工期。但是，招標人對工程設計細節和施工的調控影響力較小，所以透過招標選擇同時具有設計和施工專業素質以及綜合協調管理水平較高的工程總承包人，併合理清晰界定相關責任、風險就非常重要。