明清時期設定的總督一職，分為地方最高軍政長官的總督、管理專門事務的總督兩類，漕運總督既為管理專門事務的總督之一。

一、地方最高軍政長官的總督，督撫同城時有的“兼理巡撫”，江河事務繁重地域有的“兼理操江、河道事務”，直隸、兩江總督分別“署理北、南洋通商大臣”，直隸總督還兼管北洋水師。

總督，為地方官員中級別最高、權力最大的軍政官員，官階為正二品，加兵部尚書、右都御史銜則為從一品，加大學士銜則為正一品，習稱“封疆大吏”，權勢顯赫。

總督管轄軍隊，只限管轄漢軍綠營軍隊，管轄的漢軍綠營軍隊稱“督標”，八旗軍隊歸駐防各地的滿族將軍管轄。

計設有直隸、兩江、兩廣、湖廣、閩浙、雲貴、陝甘、四川八總督，後增加東三省總督，除四川總督管轄一省，其他總督管轄多省軍政事務，但以軍事為主。

總督，類似新中國成立初期設立的東北、華北、西北、西南、華東、中南六個大區政府主席，管轄數省，但比大區政府主席權力更大，比大區政府主席還多執掌軍權，外經貿權。

二、管理專門事務的總督，計有河道總督、漕運總督。

（一）河道總督，專事負責疏浚河道，修繕河堤等河務管理事務，管轄計程車兵稱河兵役卒。

設有南河、北河二河道總督，河道總督不及地方最高軍政長官的總督權力大，官職顯赫，人力怎能勝天，敢保不潰堤發水，是一個責任重大、操心費力的苦差事。

（二）漕運總督，明成祖朱棣時定都北京，清朝相沿。軍民食用需要大量的糧食，從江浙等南方調運，當時依託京杭大運河水運，後期也曾海運進京，稱為“漕運”，漕運總督“應運而生”，駐節今江蘇省淮安市，專事管理漕運事務，管轄計程車兵稱漕兵役卒，漕運也衍生出民間幫會組織“青幫”。

漕運總督為正二品官員，加兵部尚書、右都御史銜為從一品。

漕運總督，看似不如地方最高軍政長官的總督權勢，但卻是一個肥得流油的美差事。

僅供參考。

大運河自始建起，一個主要功能就是“運輸皇糧”。國家組織官員從涉河省份徵收米石，再沿大運河運送到交易樞紐北京通州，所以大運河又稱漕河，所運米石又稱"漕糧"。

因為有元一代的大力改造，運河變得越來越直，明朝在此基礎上又對運河進行了進一步疏通，大運河的水運價值迅速提升。大運河貫通後，為了確保其隨時暢通，對運河航道的治理維護就變得越來越重要了。

景泰二年（1451年），明朝的漕運出現了問題，無法按時為京城運輸漕糧。有鑑於此，中央決定設定漕運總督一職，專職管理漕運。

第一代漕運總督由當時的副都御使王竑兼任，治所在淮安。明代漕運總督的職責除了督促涉漕各省按時上繳運送漕糧到京城外，還要監管運河航道的治理維護。另外，漕運總督還有巡撫鳳陽等地的權力。

明成化七年（1471年）十月，鑑於運河河道淤塞，導致漕運受阻，朝廷便委任刑部左侍郎王恕兼任河道總督，駐地山東濟寧，專職負責運河的治理維護。從此，漕運總督和河道總督共同管理運河事務。

不過，多數時間裡，明代的漕運總督和河道總督都不是固定官職，只是有需要時他們才作為中央代表出京督漕或治河，帶有一種臨時派遣的性質。

到了清代，朝廷對京杭大運河愈發重視，管理也進一步加強。順治元年，中央正式將漕運總督和河道總督納入官制。兩總督品秩皆為正二品，但這兩個職位往往都由兵部侍郎或都察院副都御使兼任，所以漕運總督和河道總督多數時候都是從一品大員，與地方總督同一級別。二者官帽皆飾紅寶石，蟒袍皆為九蟒五爪，補服皆飾仙鶴。

但漕運總督和河道總督的收入並不是很高，每年的俸祿只有180兩銀，年養廉銀稍微多點，大概在一萬五千兩到三萬兩之間。

漕運總督下設巡漕御史、管糧同知等官職，河道總督至乾隆以後，定為道、廳、汛三級管理機構，各級下設河道、通判等官職。兩總督所轄軍隊分別稱為漕標與河標。

有清一代，由於黃河泥沙堆積嚴重，導致氾濫頻發，運河治理難度加大、任務艱鉅。隨之而來的變化是朝廷對河道總督一職愈發重視，河道總督權力上升，漸漸凌駕於漕運總督之上。

甚至有時河道總督可以代理漕運事務。但同時由於運河情況複雜，治理維護殊為不易，所以河道總督落馬的風險係數也比漕運總督高。 到咸豐五年（1855年），由於黃河變道山東入海，導致大運河受阻嚴重，航運價值衰落，漕運總督和河道總督就自然沒有存在的必要了，之後被陸續取消職位。