在美國南北戰爭前，有一個叫湯姆.索亞的小男孩。他十分的貪玩好耍，這一點令他的姨媽十分頭疼。但同時，他也機智勇敢，充滿正義感，並且酷愛冒險。

有一次，他和他的好夥伴哈克一起去墳場深夜試膽，結果看到盜墓賊印第安.喬伊親手殺死了羅賓遜大夫。他們害怕得要死，趕快往回跑，但是也因為過於恐懼，他們不敢隨意透露這件事。之後，印第安.喬把殺人這個罪行嫁禍給了那天夜裡和他同行的酒鬼穆夫.波特，可憐的“殺人犯”就這樣被送進了監獄裡，只等法庭做出最後的庭審了。湯姆也對這件事感到無比的愧疚與自責。

在這件事之後的一天夜裡，認為被世界拋棄的湯姆與與他同感的哈克、喬.哈珀二人偷偷來到了一座無人小島當海盜。在島上，他們玩得十分快樂，但是快樂過去後，就是無比的思念家鄉。終於有一天，他們實在是受不了了，在週日家鄉舉辦他們的葬禮時，出現在了教堂裡，奇蹟般“重生”了。

在法庭庭審的前一天，湯姆正義感爆棚，說出了那件謀殺案背後的真相。最終，波特無罪釋放，但是喬伊也越獄了。

喬伊越獄後的某一天，湯姆和哈克來到可怕的鬼屋尋寶。可誰料遇上了逃犯喬伊，他們趕緊在鬼屋的二樓躲好，才沒被他發現。但是，寶藏也被喬伊拿走了。

之後，在貝基舉辦的野餐會里，湯姆、貝基和一些小孩們發現了一個大山洞。湯姆和貝基就一起在山洞探險，結果迷路了，更壞的是還遇上了打算藏寶的喬伊。但萬幸的是他們最終還是逃出了山洞，得到了寶藏，喬伊也被困死在了山洞裡。

故事的最後，湯姆和哈克一同加入了“強盜幫”。