在套期保值的實際操作中，大多數並不能像書中的例子那麼直接且消除幾乎所有風險，這主要是因為：

①希望對沖的資產與期貨合約標的資產可能並不完全一致；

②套期保值者對資產何時購買或出售的確切時間並不確定；

基差風險會使套保者頭寸改善或惡化。對空頭套保而言，如果在未預期情況下基差加強即基差增大，套保者的頭寸改善；如果基差減弱即基差減小，那麼套保者的頭寸惡化。對多頭套保則情況相反。如果套保者要對沖的資產與期貨合約的標的資產不一致，將使基差風險增加。

影響基差風險的一個關鍵因素是對套保期貨合約的選擇問題。這種選擇包含兩部分：

一、是對期貨合約標的資產的選擇；

二、是交割月份的選擇。

如果所需要進行套保的資產與期貨合約的標的資產完全一致，那麼第一種選擇通常是很容易的。在其他情況下，則需要仔細分析以確定可獲得的期貨合約哪種期貨價格與需要套保的資產更密切相關。

在實際操作中，通常都會選擇更遲一些交割的合約。這主要是因為交割月內期貨價格在某些情況下更加不穩定，而且進行多頭套保的套保者在交割月內要承擔進行實物交割的風險。進行實物交割是成本昂貴且非常不方便的，多頭套保者還是更喜歡把期貨合約平倉並從他們通常的供應商那裡購買所需資產。

通常，套保期結束時間與交割月份之間的差異越大基差風險越大。因此，一個好的法則就是選擇交割月更加臨近但也比套保期結束時間晚的交割月份。假設，一項資產的期貨合約的交割月份分別為3月、6月、9月和12月，而套保期將在12月、1月和2月結束，那麼3月期貨合約將會被選擇；如果套保期將在3月、4月和5月結束，那麼6月期貨合約將被選擇。這個規則假設了所有合約都具有充分的流動性以滿足套保者的要求。現實中，距離到期日短的期貨合約的流動性趨向於最大。因此，某些情況下，套保者傾向於使用到期日短的期貨合約並將這些合約進行展期。