《紅樓夢》的結構縝密、敘事年歲月序極其條理，但因書稿未最終定稿，難免存在個別疏漏之處。包括時間、年齡上的BUG。

紅樓夢一書，作者是基本完成了的，但沒有最終定稿，作者“披閱十載，增刪五次”，在增刪過程中，難免前後有不一致的地方。僅看時間方面的疏漏，不止是題主所說的英蓮年齡的bug。

關於此，推薦看周汝昌的《紅樓紀曆》、周紹良的《紅樓夢繫年》等。前輩學者爬梳紅樓夢繫年的不少，其中因對文字理解不同，也有一些爭議。如果題主有興趣，也可自己逐個章回細讀筆記，做一個自己的系年。

關於題主所說英蓮年齡

周汝昌在紅樓紀曆裡考證過：

按英蓮開場為三歲，到今年應為九歲；雲“十一二歲轉賣”，又云“十二三歲光景”，約度之詞，不覺稍大。又按自雨村離葫蘆廟至此跨七年，雲“八九年來”；自英蓮失蹤至此跨五年，雲“隔了七八年”，皆多出二三年。揆其原故，蓋雪芹又皆從第一回開場時計起也。

紅樓系年，以寶玉降生為紅樓元年。按照第一回推測，英蓮被拐時，應為5歲。

紅元年，英蓮出場，時為3歲。

只有一女，乳名英蓮，年方三歲。一日，炎夏永晝。士隱於書房閒坐，至手倦拋書，伏几少憩，不覺朦朧睡去。夢至一處，不辨是何地方。忽見那廂來了一僧一道

也就是說，三歲這一年炎夏，她爸甄士隱作夢，見僧道帶“頑石”下凡歷劫，也就是暗寫寶玉出生。

接下來，寫到：

“一日，早又中秋佳節。”士隱家宴已畢，乃又另具一席於書房，卻自己步月至廟中來邀雨村。

這個中秋節裡，士隱、雨村提“明歲大比”，賈雨村第二天，八月十六就進京去了。

紅二年

第二年，賈雨村參加了大比，在第二回裡追述了此事：　　　

雨村因那年士隱贈銀之後，他於十六日便起身入都，至大比之期，不料他十分得意，已會了進士，選入外班。

賈雨村是在紅二年中進士的。這一年，黛玉出生。黛玉比寶玉小一歲。

紅三年

英蓮被拐。如果按照第四回推算，英蓮應該是紅三年被拐的，不是紅二年。

第一回雲：

真是閒處光陰易過，倏忽又是元霄佳節矣。士隱命家人霍啟抱了英蓮去看社火花燈，半夜中，霍啟因要小解，便將英蓮放在一家門檻上坐著。待他小解完了來抱時，那有英蓮的蹤影？

此元宵節，第一回只是說“又是元宵佳節”，沒有明確是第二年的元宵節，從第四回看，應該是第三年的元宵節，不是第二年的。第四回雲：英蓮是5歲被拐，如今十二三歲。

雨村罕然道：“原來就是他！聞得養至五歲被人拐去，卻如今才來賣呢？”門子道：“這一種柺子單管偷拐五六歲的兒女，養在一個僻靜之處，到十一二歲，度其容貌，帶至他鄉轉賣。當日這英蓮，我們天天哄他頑耍，雖隔了七八年，如今十二三歲的光景，其模樣雖然出脫得齊整好些

但是，第63回裡，“香菱、晴雯、寶釵三人與他（襲人）同庚”，寶釵長寶玉三歲，推至紅元年，寶玉一歲，寶釵四歲，香菱也應該為四歲。與第一回“英蓮年方三歲”不符。與第6回裡，襲人年紀比寶玉大兩歲，也不符。

關於題主所提到的黛玉“十三歲”的問題

“十三歲”來自己卯本、夢本。參周汝昌紀曆考證：

第三回：

“擇了出月初二日”，與黛玉同路入都。“有日，到了都中。”“不上兩個月”，應天府缺出，雨時赴任。黛玉初入榮府。眾人見她“年貌雖小”；在家時如海亦囑咐：“且汝多病，年又極小。”蓋此時黛玉年僅六歲。（己卯本、“夢稿”本於此獨多“十三歲”之文，他筆妄加，謬甚）

此類疏漏還有很多，大家可參看前輩學人的系年，不一一列舉。

紅樓夢基於象徵，時間也是，沒有也不會有準確的時間連續，核心是十三，出自《對子歌》——十三元，十四寒，十五刪，黛玉進入賈府時，黛玉是九歲，寶玉是十歲，寶釵是十一，襲人是十二歲，到六十三回，寶玉慶壽時，寶玉正是十三歲，這些都是基於對子歌，核心是十三元，對子歌十三元，在明初朱元璋時曾諱皇帝名而刪改，所以元是紅樓夢的真事隱，也是甄士隱，甄士隱即是朱元璋。

紅樓夢是一部小說，而非歷史史實。

紅樓夢的創作是經過一個艱辛漫長的過程。正如作者所說，披閱十載，增刪五次。紅樓夢所描寫的人物中，有名有姓的就多達七百餘人。重大的增刪加上描寫的人物眾多，因此個別人在時間方面出現bug，或者疏漏在所難免。

紅樓夢在早期是手抄形式流傳下來的，一傳十，十傳百，傳抄者的主客觀因素，某些方面出現bug或疏漏也是正常的。

這世界沒有十全十美，所有的事情都要留有缺憾，沒有缺憾的人生才不完美。就像書中所說真真假假，假假真真，假作真時真亦假，凡事不要太苛求。