作為保護傘之一的馬雲波，自從陳光榮死後，就一直沒有睡過一個安穩覺，一邊備受林耀東的威脅，另一邊也擔心自己的事情被李飛等人發覺。

伴隨著馬雲波的糾結，觀眾們也開始關注他的結局是否會再次反轉，看到他的無奈與掙扎，大家都開始同情這個被迫成為黑警的人。

馬雲波本人其實恨透了毒梟，要不是毒販報復，他的老婆不會身中150多發子彈，導致如今只能利用海洛因止痛。如果不是這個軟肋被林耀東抓住，馬雲波不會被迫成為他的保護傘。 陳光榮死後，馬雲波就知道了自己的結局，一旦被發現，不僅是自己的官職丟了，在林耀東那裡也就沒了利用價值，那麼他也就只有死路一條了。

所以他就開始蒐集林耀東的犯罪證據，每一次跟林耀東的對話，他都偷偷的錄了音，為的就是將來如果自己暴露了，或者林耀東暴露了，自己可以將證據拿出來，也算是將功補過了。 可是自己最大的牽掛就是老婆于慧，于慧的毒癮已經不可能戒掉了，即使林耀東被抓了，于慧仍然需要吸毒。即使給於慧戒了毒，可是身體中那幾顆子彈會讓于慧疼的生不如死，一定會再次復吸。

于慧也知道自己給丈夫帶來了很多的麻煩，所以之前就想要跟馬雲波離婚，這樣就不會再拖累馬雲波了。 可是馬雲波怎麼可能放開于慧的手呢，于慧之所以會這樣，都是因為自己，所以他沒有辦法跟于慧離婚，也沒有辦法看著她疼的不能自已阻止她吸毒，就只能任憑林耀東抓著自己的軟肋。

馬雲波再次找李飛吃飯，其實不過就是想要看看李飛究竟把塔寨的案子查的怎麼樣了。李維民被省紀檢委帶走，蔡永強說話做事又滴水不漏，只有李飛是他的突破口。 在和李飛吃飯過程中，馬雲波試探著問了一些問題，從李飛的態度中，馬雲波看出了李飛對自己的懷疑，他知道自己已經成了李飛和蔡永強懷疑的物件。

馬雲波也知道，李維民雖然被紀檢委帶走了，但是早晚有一天，李維民會回來，回來後他最先要處置的就是自己。 于慧本來就已經覺得自己拖累了馬雲波，這次李飛的懷疑讓于慧更加自責，但是馬雲波也意識到了自己的問題，他覺得需要正視自己的錯誤。

馬雲波正視了自己的問題，這一次他要豁出去做一個緝毒警該做的事情了。 在李維民和趙嘉良的裡應外合之下，林耀東開啟了村內製毒的生產線，在村內開工的那一刻起，他就已經咬上了李維民的魚餌。

據說當村內製毒現場被查到以後，林耀東卻早就已經坐車跑走了，是馬雲波親自追上了他將他繩之以法的，也算是為自己和老婆出了一口惡氣吧。 馬雲波將自己蒐集的林耀東犯罪的證據交給了李維民，並且將自己這些年幫助林耀東做的事情也全盤交代了，雖然他最終迷途知返，為破獲塔寨製毒案提供了有力的證據，但是他犯罪也是事實，所以最終馬雲波並沒有死，只是被蔡永強逮捕了而已。 如果說馬雲波這樣的結局真的跟李飛有關的話，大概就是李飛的懷疑，讓馬雲波那顆搖擺的心定了下來，讓他知道了他唯一的選擇，就是最後再做一次真正的緝毒警。

在大結局中，馬雲波最終並沒有死，而是被判了12年有期徒刑。

馬雲波的結局和李飛的關係不大，頂多是為了兌現和李飛的諾言，把林耀東活著交給了李飛，對於整個劇的結局走向而言，作用也不大。唯一可惜的是，馬雲波沒能保住良叔的命。

其實當初電視劇拍攝的時候還有另一個版本的結局。就是馬雲波把李飛和林耀東帶到海邊，把林耀東交給李飛之後，他就跳海自殺了。

因為這片海域就是馬雲波的妻子于慧自殺身亡的地方，馬雲波一開始把最後交接的地方選在這裡，就應該存著要自我了斷的心思。這樣的結局，會使得馬雲波這個人物悲劇的一生更加慘烈。

于慧既然能夠為了成全馬雲波的大義，義無反顧為愛犧牲，那麼馬雲波對於能和于慧相聚，也不會眨一下眼睛。能夠和自己最愛的人死在一處，其實對於馬雲波和于慧這一對賺走了觀眾不知多少眼淚的悲情cp而言，也是一個圓滿的結局了。

不過最後導演並沒有選擇這個結局也是可以理解的。

馬雲波身為一名人民警察卻知法犯法，縱容妻子吸毒不算，還為大毒梟林耀東提供保護傘，成了警察中的奸細。

雖然在最後時刻他幫助警方活捉了林耀東，也交出了林耀東製毒販毒的犯罪證據，算是戴罪立功，但是知法犯法這件事還是非常惡劣的，應該要得到應有的法律制裁，才能以儆效尤。