現代生物技術常用技術一般包括基因工程、細胞工程、酶工程、發酵工程和蛋白質工程。

基因工程（genetic engineering）又稱基因拼接技術和DNA重組技術，是以分子遺傳學為理論基礎，以分子生物學和微生物學的現代方法為手段，將不同來源的基因按預先設計的藍圖，在體外構建雜種DNA分子，然後匯入活細胞，以改變生物原有的遺傳特性、獲得新品種、生產新產品。

透過細胞工程可以生產有用的生物產品或培養有價值的植株，並可以產生新的物種或品系。

酶工程（英語：Enzyme engineering）又稱蛋白質工程學，是指工業上有目的的設定一定的反應器和反應條件，利用酶的催化功能，在一定條件下催化化學反應，生產人類需要的產品或服務於其它目的的一門應用技術。

發酵工程的內容包括菌種的選育、培養基的配製、滅菌、擴大培養和接種、發酵過程和產品的分離提純等方面。

蛋白質工程就是透過對蛋白質化學、蛋白質晶體學和蛋白質動力學的研究，獲得有關蛋白質理化特性和分子特性的資訊，在此基礎上對編碼蛋白質的基因進行有目的的設計和改造，透過基因工程技術獲得可以表達蛋白質的轉基因生物系統，這個生物系統可以是轉基因微生物、轉基因植物、轉基因動物，甚至可以是細胞系統。