在配種的最佳時機，適時配種能有效地提高母犬的受胎率和產仔率，過早過晚配種都使母犬的受胎率有所降低。配種時機的確定，主要是根據母犬的發情徵候及排卵時間來確定，以便使精子和卵子在活力最強時授精而受胎。

配種的最佳時機是在母犬排卵前1.5天到排卵後4.5天之間，可能受胎的交配範圍較大。但是，母犬的排卵時間無法透過常規檢查來確定。一般的經驗是，母犬在開始發情後，進入發情期的第2或第3天（也就是犬開始發情活動的第11～12天）首次交配，間隔1～3天再交配一次。這個時期母犬開始排卵，而且生殖道也為交配做好準備，並願意接受交配，此時母犬陰門充分腫脹，甚至外翻，生殖道黏液量開始減少，顏色由開始的血紅色變為淡紅色或不見血。用手按壓母犬腰部，母犬站立不動，陰門頻頻開張，排尿頻繁，讓公犬嗅聞陰部，接受爬跨，這種表現就是適時配種時期。

另外，也可以根據母犬發情出血的情況來確定，從母犬開始發情出血開始之日起，到出血後的第9～13天之內，是最佳交配時期。有實驗表明，這段時間也是開始排卵到排卵停止的時期。

適時配種時期與母犬的年齡也有一定關係。一般情況下，青壯年犬發情出血時間較長，老弱母犬發情出血時間較短。因此，在按發情出血後第9～13天進行配種時，一般是老的犬交配時間提前高1天，青壯年犬推後1天。此謂“老配早，少配晚，不老不小配中間”。