發酵是中藥炮製的一種重要方法，近年來，有關應用現代生物技術發酵中藥的研究越來越多，它的好處有：

1.保護中藥活性成分免受破壞

微生物發酵是在常溫、常壓等較為溫和的條件下進行的生長代謝和生物轉化，故能最大限度地保護中藥活性成分免遭破壞，特別是對熱敏感的芳香類揮發油、蛋白質、維生素、氨基酸、微量元素等活性成分，如薄荷、當歸等中藥，解決了中藥在煎、煮、熬、煉、蒸、浸等傳統加工工藝中, 活性成分易於破壞的難題。相關研究表明應用生物工程技術發酵中藥黃芪，結果發現，發酵黃芪所含黃芪多糖是普通煎、煮、熬水提法的 5 倍，等量黃芪發酵藥效約是一般煎、煮、熬水的 28 倍。

2.疊加發酵益生菌功能

微生態中藥製劑是根據中醫藥學、醫學微生態學、微生物學、營養學等學科理論，在傳統中藥製劑的製備中，引入益生菌等有益微生物發酵中藥，並採用酶水解菌種培養基等現代生物技術生產中藥製劑。由於正常微生態菌能夠參與機體的多種生理功能，如糖、氮質、脂類、無機鹽代謝和維生素等物質的合成，增強機體抗病力，同時還能提高機體對中藥的吸收和利用，因此應用微生態菌發酵中藥，可集發酵中藥製劑和微生態製劑雙重功能，其臨床效果優於常規微生物發酵製劑。

3.提高中藥有效成分提取率

應用微生物發酵中藥時，微生物可利用中藥成分作為營養物質進行生長、繁殖和代謝，微生物代謝過程中分泌的蛋白酶、纖維素酶、半纖維素酶、果膠酶、澱粉酶、脂酶等胞外酶，使細胞破裂，從而利於中藥有效成分從胞內釋放，使中藥有效組分、活性物質最大限度地得以提取和利用。

4.降解中藥大分子物質

中藥活性成分大多結構複雜，在發酵中藥過程中，微生物的生長代謝具有強大的分解轉化能力，能將許多不能直接吸收利用的大分子有效活性物質降解為小分子活性物質，小分子活性物質可透過血腦屏障，並與機體的細胞蛋白結合，從而易於機體對有效成分的吸收和利用，提高中藥的治療效果，因此，發酵中藥具有更高的生物活性。

5. 產生新的活性物質

在微生物發酵中藥過程中，中藥某些成分可能對微生物的生長代謝及其活性成分的產生有促進或抑制作用，而微生物在中藥特殊環境中也有可能改變自身的代謝途徑，在生長過程中產生豐富的初生或次生代謝產物，有些代謝產物自身就是功效良好的藥物，此外，以中藥一些成分為前體，經酯化、氧化、葡萄糖基化等多種生物轉化途徑，可生成新的化合物。應用枯草芽孢桿菌對三七根進行發酵，在對發酵中藥的皂苷成分研究時發現，從發酵後的三七中分離出被微生物轉化的人參皂苷 RH4。

6.降低中藥毒副作用

微生物的分解轉化作用有可能將中藥中的有毒成分，如生物鹼類、苷類、內酯類、蛋白類、重金屬等成分進行分解，或對中藥有毒活性成分進行結構修飾，從而降低中藥的毒副作用。研究表明，用酵母菌發酵大黃，可以使大黃中等總蒽醌含量有所降低。結合型蒽醌含量降低，分離型蒽醌含量增加，可以起到減毒增效的作用。

眾多的研究已經表明，發酵中藥是現代生物技術和中藥研究的完美結合。利用微生物發酵中藥，能提高發酵中藥製劑活性成分等含量，增強療效，改變原有效能。隨著現代科學技術和現代醫藥產業的發展，生物發酵中藥將具有更加廣闊的發展空間。

中藥發酵炮製的實質是利用微生物對藥材進行的生物轉化，經過發酵可以改變藥物藥性、增效減毒，從而使藥材的藥理作用發生變化產生新的化學成分。與煨、炒、煅、炮、煉、焙、烘、烤等其他中藥炮製方法相比，發酵法是在常溫常壓條件下進行的，反應條件溫和、操作簡單，同時轉化反應中利用了產生於微生物生長代謝過程中的酶，酶選擇性的對底物進行結構修飾，所以能進行一些其他炮製方法無法實現的反應，以低成本、少公害的優勢獲得活性更好、結構更合理的中藥成分。

與其他中藥炮製方法相比，發酵中藥的優勢在於，微生物可以除去大分子雜質，將不能被人體直接利用的有效活性組分降解成小分子活性物質，從而使發酵中藥能被人體快速吸收，大大提高了藥效。在王林等的實驗中，用萊菔子、麻黃、連翹、金銀花4 味中藥發酵靈芝菌，實驗結果表明，發酵後靈芝菌的生物量顯著增加，與發酵前相比靈芝液的去痰止咳作用也大

經過發酵，中藥在微生物的作用下有毒物質被分解，從而藥物的毒副作用降低了。以大黃為例，結合型蒽醌衍生物( 二蒽醌番瀉苷) 是其產生瀉下作用的主要成分，為了緩和大黃對胃腸道的這種不良反應，臨床應用中就要採用炮製手段把結合型蒽醌衍生物分解或破壞掉。相關學者研究表明，採用發酵法炮製大黃，發酵後結合型蒽醌衍生物含量降低，而具有抗腫瘤作用的遊離型蒽醌的含量增加了6倍，從而改變了大黃的蒽醌類成分的含量，達到了減毒增效的作用。

中藥發酵技術是在中藥理論基礎上，與現代生物技術完美結合，已逐步成為中藥新藥研究開發的重要手段，為中藥改進劑型、擴大治療範圍及中藥新藥創制提供了新的途徑，因此中藥發酵技術必將有廣闊的發展前景