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關節性疾病：　　包括老年人退行性關節炎、關節活動障礙、肩周炎、腰椎病、頸椎病等;辦公室白領因工作性質導致的腰椎病、頸椎病需要經過醫生辨證之後，才可判斷是否適合艾灸。證型屬於肝陽上亢型的關節性疾病是不適宜艾灸的。

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消化系統疾病：　　包括十二指腸潰瘍、慢性胃炎、慢性結腸炎、胃腸功能障礙等疾病;另外就是辨證為虛寒型的拉肚子、胃脹、胃痛，也可透過艾灸治療。　　

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雜病　　例如一些常見的婦科、男科疾病，慢性盆腔炎、前列腺炎等。還有一些屬於虛寒型的症狀如小便清長、腰膝痠軟、下腹墜脹等也屬於艾灸的治療範圍。 頑固性疾病　　包括強直性脊柱炎，一些透過中醫的辨證，屬於虛寒性的診斷不明，沒有辦法解釋的功能性疾病。　　專家這樣解釋到，艾灸治療疾病是從辨證論治的角度出發的，即便是同一個疾病，選取的穴位也可能有所不同，所以要嚴格根據疾病來分艾灸穴位的話，比較難。但是可以根據疾病型別選取一些通用的穴位，來達到保健和防治的作用。

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保健選穴：　　兒童方面多見的是腹瀉、腹脹等消化系統的疾病或者是感冒、咳嗽等呼吸系統的疾病，所以以保健來論，艾灸選穴建議選取：大椎、肺俞、足三里、大腸俞等。　　老人方面多見是一些虛寒類的疾病如關節退行性病、區域性肌肉關節疼痛等。艾灸選穴建議以滋養肝腎，提升陽氣為主，建議選取：命門、百會、足三里及阿是穴。　　婦科、男科保健方面建議可以選取腹部和腰骶部的一些保健穴位，女性還可以選取子宮一穴作為日常保健。　　手腳冰涼的人群可以選取大椎、關元、足三里及四肢末端的一些穴位來減輕手腳冰涼的症狀。　　補腎、補脾可以選擇腎俞、脾俞、命門。　　

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疾病選穴：　　消化性疾病、女性的子宮下垂、頭暈可以選擇百會穴治療。　　失眠：透過辨證非陰虛、熱證之後可以選擇百會、風池、三陰交及足三里治療。　　頸椎病、頸部疼痛可以選擇風池、大椎、督脈和膀胱經上的一些穴位來治療。　　肩部疼痛可以選擇肩髎、肩髃、手臂等穴位。