國家三級保護動物有：獸綱 MAMMALIA 6目14科88種刺蝟、達烏爾蝟、大耳蝟、侯氏蝟、樹鼩、狼、赤狐、沙狐、藏狐、貉、鼬、白鼬、伶鼬、黃腹鼬、小艾鼬、黃鼬、紋鼬、艾鼬、虎鼬、鼬獾、緬甸鼬獾、狗獾、豬獾、大斑靈貓、椰子狸、果子狸、小齒椰子貓、縞靈貓、紅頰獴、食蟹獴、雲貓、豹貓、野豬、赤麂、小麂、菲氏麂、毛冠麂、狍、馴鹿、草兔、灰尾兔、華南兔、東北兔、雲南兔、東北黑兔、毛耳飛鼠、復齒鼯鼠、棕鼯鼠、雲南鼯鼠、海南鼯鼠、紅白鼯鼠、臺灣鼯鼠、灰鼯鼠、慄褐鼯鼠、灰背大鼯鼠、白斑鼯鼠、小鼯鼠、溝牙鼯鼠、飛鼠、黑白飛鼠、羊絨鼯鼠、低泡飛鼠、松鼠、赤腹松鼠、黃足松鼠、藍腹松鼠、金背松鼠、五紋松鼠、白背松鼠、明紋花松鼠、隱紋花松鼠、橙腹長吻松鼠、泊氏長吻松鼠、紅頰長吻松鼠、紅腿長吻松鼠、橙喉長吻松鼠、條紋松鼠、巖松鼠、側紋巖松鼠、花鼠、掃尾豪豬、豪豬、雲南豪豬、花白竹鼠、大竹鼠、中華竹鼠、小竹鼠、社鼠[1] 鳥綱 AVES 18目61科707種紅喉潛鳥、黑喉潛鳥、小鸊鷉、黑頸鸊鷉、鳳頭鸊鷉、黑腳信天翁、白額鸌、灰鸌、短尾鸌、純褐鸌、白腰叉尾海燕、黑叉尾海燕、白尾鸏、普通鸕鷀、暗綠背鸕鷀、紅臉鸕鷀、小軍艦鳥、白斑軍艦鳥、蒼鷺、草鷺、綠鷺、池鷺、牛背鷺、大白鷺、白鷺、中白鷺、夜鷺、慄鳽、黑冠鳽、黃葦鳽、紫背葦鳽、慄葦鳽、黑鳽、大麻鳽、東方白鸛、禿鸛、大紅鸛、黑雁、鴻雁、豆雁、小白額雁、灰雁、斑頭雁、雪雁、慄樹鴨、赤麻鴨、翹鼻麻鴨、針尾鴨、綠翅鴨、花臉鴨、羅紋鴨、綠頭鴨、斑嘴鴨、赤膀鴨、赤頸鴨、白眉鴨、琵嘴鴨、雲石斑鴨、赤嘴潛鴨、紅頭潛鴨、白眼潛鴨、青頭潛鴨、鳳頭潛鴨、斑背潛鴨、棉鳧、瘤鴨、小絨鴨、黑海番鴨、斑臉海番鴨、醜鴨、長尾鴨、鵲鴨、白頭硬尾鴨、白秋沙鴨、紅胸秋沙鴨、普通秋沙鴨、松雞、雪鶉、石雞、大石雞、中華鷓鴣、灰山鶉、斑翅山鶉、高原山鶉、鵪鶉、藍胸鶉、環頸山鷓鴣、紅胸山鷓鴣、綠腳山鷓鴣、紅喉山鷓鴣、白頰山鷓鴣、褐胸山鷓鴣、白眉山鷓鴣、臺灣山鷓鴣、棕胸竹雞、灰胸竹雞、藏馬雞、雉雞、普通秧雞、藍胸秧雞、紅腿斑秧雞、白喉斑秧雞、小田雞、斑胸田雞、紅胸田雞、斑脅田雞、紅腳苦惡鳥、白胸苦惡鳥等兩棲綱 PHIBIA 3目10科291種版納魚螈、無斑山溪鯢、龍洞山溪鯢、山溪鯢、北方山溪鯢、鹽源山溪鯢、安吉小鯢、中國小鯢、臺灣小鯢、東北小鯢、滿洲小鯢、能高山小鯢、巴鯢、爪鯢、商城肥鯢、新疆北鯢、秦巴北鯢、極北鯢、呈貢蠑螈、藍尾蠑螈、東方蠑螈、潮汕蠑螈、滇池蠑螈、琉球棘螈、黑斑肥螈、無斑肥螈、尾斑瘰螈、中國瘰螈、富鍾瘰螈、廣西瘰螈、香港瘰螈、棕黑疣螈、強婚刺鈴蟾、大蹼鈴蟾、微蹼鈴蟾、東方鈴蟾、沙坪無耳蟾、寬頭短腿蟾、緬北短腿蟾、平頂短腿蟾、沙巴擬髭蟾、東南亞擬髭蟾 、高山掌突蟾、峨山掌突蟾、掌突蟾、腹斑掌突蟾、淡肩角蟾、短肢角蟾、尾突角蟾、大圍山角蟾、大花角蟾、腺角蟾、肯氏角蟾、掛墩角蟾、白頜大角蟾、莽山角蟾、小角蟾、南江角蟾、峨眉角蟾、突肛角蟾、粗皮角蟾、凹項角蟾、棘指角蟾、小口擬角蟾、突肛擬角蟾、川北齒蟾、棘疣齒蟾、景東齒蟾、利川齒蟾、大齒蟾、密點齒蟾、峨眉齒蟾、秉志齒蟾、寶興齒蟾、紅點齒蟾、疣刺齒蟾、無蹼齒蟾、鄉城齒蟾、高山齒突蟾、西藏齒突蟾、金項齒突蟾、胸腺齒突蟾、貢山齒突蟾、六盤齒突蟾、花齒突蟾、刺胸齒突蟾、寧陝齒突蟾、林芝齒突蟾、平武齒突蟾、皺皮齒突蟾、錫金齒突蟾、圓疣齒突蟾、巍氏齒突蟾、哀牢髭蟾、峨眉髭蟾、雷山髭蟾、劉氏髭蟾、哀牢蟾蜍、華西蟾蜍、盤谷蟾蜍、隱耳蟾蜍、頭盔蟾蜍、中華蟾蜍、喜山蟾蜍、沙灣蟾蜍、黑眶蟾蜍、岷山蟾蜍、新疆蟾蜍、花背蟾蜍、史氏蟾蜍、西藏蟾蜍、圓疣蟾蜍、綠蟾蜍、臥龍蟾蜍、鱗皮厚蹼蟾、無棘溪蟾、疣棘溪蟾、華西樹蟾、中國樹蟾、貢山樹蟾、日本樹蟾、三港樹蟾、華南樹蟾、秦嶺樹蟾、昭平樹蟾、雲南小狹口蛙、花細狹口蛙、孟連細狹口蛙、北方狹口蛙、花狹口蛙、四川狹口蛙、多疣狹口蛙、大姬蛙等。爬行綱 REPTILIA 2目20科395種平胸龜、大頭烏龜、黑頸水龜、烏龜、黃緣盒龜、黃額盒龜、黃金龜、金頭閉殼龜、百色閉殼龜、潘氏閉殼龜、瓊崖閉殼龜、周氏閉殼龜、齒緣龜、艾氏擬水龜、黃喉擬水龜、臘戍擬水龜、缺頜花龜、菲氏花龜、中華花龜、鋸緣攝龜、眼斑龜、擬眼斑龜等。昆蟲綱 INSECTA 17目72科120屬另110種江西叉突襀、海南華鈕襀、吉氏小扁襀、史氏長卷襀、怪螳屬（所有種）、魏氏巨蝓、四川無肛蝓、尖峰嶺彪蝓、汙色無翅刺蝓、葉蝓屬（所有種）、廣西瘤蝓、褐脊瘤胸蝓、中華仿圓筒蝓、食蚧雙突圍齧、線斑觸齧、黃脊扁角紋薊馬、墨脫埃蛾蠟蟬、紅翅梵蠟蟬、漆點旌翅顏蠟蟬、碧蟬屬（所有種）、彩蟬屬（所有種）、琥珀蟬屬（所有種）、硫磺蟬屬（所有種）、擬紅眼蟬屬（所有種）、篤蟬屬（所有種）、西藏管尾犁胸蟬、周氏角蟬、新象棘蟬、野核桃聲毛管蚜、柳粉蝨蚜、田鱉、山字寬盾蝽、海南杆蝓豬蝽、中華脈齒蛉、碩華盲蛇蛉、中華旌蛉、雙鋸球胸虎甲、步甲屬拉步甲亞屬（所有種）、步甲屬碩步甲亞屬（所有種）等合計 5綱 46目 177科 1591種 及 昆蟲120屬的所有種和另外110種。
國家三級保護動物有：獸綱 MAMMALIA 6目14科88種刺蝟、達烏爾蝟、大耳蝟、侯氏蝟、樹鼩、狼、赤狐、沙狐、藏狐、貉、鼬、白鼬、伶鼬、黃腹鼬、小艾鼬、黃鼬、紋鼬、艾鼬、虎鼬、鼬獾、緬甸鼬獾、狗獾、豬獾、大斑靈貓、椰子狸、果子狸、小齒椰子貓、縞靈貓、紅頰獴、食蟹獴、雲貓、豹貓、野豬、赤麂、小麂、菲氏麂、毛冠麂、狍、馴鹿、草兔、灰尾兔、華南兔、東北兔、雲南兔、東北黑兔、毛耳飛鼠、復齒鼯鼠、棕鼯鼠、雲南鼯鼠、海南鼯鼠、紅白鼯鼠、臺灣鼯鼠、灰鼯鼠、慄褐鼯鼠、灰背大鼯鼠、白斑鼯鼠、小鼯鼠、溝牙鼯鼠、飛鼠、黑白飛鼠、羊絨鼯鼠、低泡飛鼠、松鼠、赤腹松鼠、黃足松鼠、藍腹松鼠、金背松鼠、五紋松鼠、白背松鼠、明紋花松鼠、隱紋花松鼠、橙腹長吻松鼠、泊氏長吻松鼠、紅頰長吻松鼠、紅腿長吻松鼠、橙喉長吻松鼠、條紋松鼠、巖松鼠、側紋巖松鼠、花鼠、掃尾豪豬、豪豬、雲南豪豬、花白竹鼠、大竹鼠、中華竹鼠、小竹鼠、社鼠[1] 鳥綱 AVES 18目61科707種紅喉潛鳥、黑喉潛鳥、小鸊鷉、黑頸鸊鷉、鳳頭鸊鷉、黑腳信天翁、白額鸌、灰鸌、短尾鸌、純褐鸌、白腰叉尾海燕、黑叉尾海燕、白尾鸏、普通鸕鷀、暗綠背鸕鷀、紅臉鸕鷀、小軍艦鳥、白斑軍艦鳥、蒼鷺、草鷺、綠鷺、池鷺、牛背鷺、大白鷺、白鷺、中白鷺、夜鷺、慄鳽、黑冠鳽、黃葦鳽、紫背葦鳽、慄葦鳽、黑鳽、大麻鳽、東方白鸛、禿鸛、大紅鸛、黑雁、鴻雁、豆雁、小白額雁、灰雁、斑頭雁、雪雁、慄樹鴨、赤麻鴨、翹鼻麻鴨、針尾鴨、綠翅鴨、花臉鴨、羅紋鴨、綠頭鴨、斑嘴鴨、赤膀鴨、赤頸鴨、白眉鴨、琵嘴鴨、雲石斑鴨、赤嘴潛鴨、紅頭潛鴨、白眼潛鴨、青頭潛鴨、鳳頭潛鴨、斑背潛鴨、棉鳧、瘤鴨、小絨鴨、黑海番鴨、斑臉海番鴨、醜鴨、長尾鴨、鵲鴨、白頭硬尾鴨、白秋沙鴨、紅胸秋沙鴨、普通秋沙鴨、松雞、雪鶉、石雞、大石雞、中華鷓鴣、灰山鶉、斑翅山鶉、高原山鶉、鵪鶉、藍胸鶉、環頸山鷓鴣、紅胸山鷓鴣、綠腳山鷓鴣、紅喉山鷓鴣、白頰山鷓鴣、褐胸山鷓鴣、白眉山鷓鴣、臺灣山鷓鴣、棕胸竹雞、灰胸竹雞、藏馬雞、雉雞、普通秧雞、藍胸秧雞、紅腿斑秧雞、白喉斑秧雞、小田雞、斑胸田雞、紅胸田雞、斑脅田雞、紅腳苦惡鳥、白胸苦惡鳥等兩棲綱 PHIBIA 3目10科291種版納魚螈、無斑山溪鯢、龍洞山溪鯢、山溪鯢、北方山溪鯢、鹽源山溪鯢、安吉小鯢、中國小鯢、臺灣小鯢、東北小鯢、滿洲小鯢、能高山小鯢、巴鯢、爪鯢、商城肥鯢、新疆北鯢、秦巴北鯢、極北鯢、呈貢蠑螈、藍尾蠑螈、東方蠑螈、潮汕蠑螈、滇池蠑螈、琉球棘螈、黑斑肥螈、無斑肥螈、尾斑瘰螈、中國瘰螈、富鍾瘰螈、廣西瘰螈、香港瘰螈、棕黑疣螈、強婚刺鈴蟾、大蹼鈴蟾、微蹼鈴蟾、東方鈴蟾、沙坪無耳蟾、寬頭短腿蟾、緬北短腿蟾、平頂短腿蟾、沙巴擬髭蟾、東南亞擬髭蟾 、高山掌突蟾、峨山掌突蟾、掌突蟾、腹斑掌突蟾、淡肩角蟾、短肢角蟾、尾突角蟾、大圍山角蟾、大花角蟾、腺角蟾、肯氏角蟾、掛墩角蟾、白頜大角蟾、莽山角蟾、小角蟾、南江角蟾、峨眉角蟾、突肛角蟾、粗皮角蟾、凹項角蟾、棘指角蟾、小口擬角蟾、突肛擬角蟾、川北齒蟾、棘疣齒蟾、景東齒蟾、利川齒蟾、大齒蟾、密點齒蟾、峨眉齒蟾、秉志齒蟾、寶興齒蟾、紅點齒蟾、疣刺齒蟾、無蹼齒蟾、鄉城齒蟾、高山齒突蟾、西藏齒突蟾、金項齒突蟾、胸腺齒突蟾、貢山齒突蟾、六盤齒突蟾、花齒突蟾、刺胸齒突蟾、寧陝齒突蟾、林芝齒突蟾、平武齒突蟾、皺皮齒突蟾、錫金齒突蟾、圓疣齒突蟾、巍氏齒突蟾、哀牢髭蟾、峨眉髭蟾、雷山髭蟾、劉氏髭蟾、哀牢蟾蜍、華西蟾蜍、盤谷蟾蜍、隱耳蟾蜍、頭盔蟾蜍、中華蟾蜍、喜山蟾蜍、沙灣蟾蜍、黑眶蟾蜍、岷山蟾蜍、新疆蟾蜍、花背蟾蜍、史氏蟾蜍、西藏蟾蜍、圓疣蟾蜍、綠蟾蜍、臥龍蟾蜍、鱗皮厚蹼蟾、無棘溪蟾、疣棘溪蟾、華西樹蟾、中國樹蟾、貢山樹蟾、日本樹蟾、三港樹蟾、華南樹蟾、秦嶺樹蟾、昭平樹蟾、雲南小狹口蛙、花細狹口蛙、孟連細狹口蛙、北方狹口蛙、花狹口蛙、四川狹口蛙、多疣狹口蛙、大姬蛙等。爬行綱 REPTILIA 2目20科395種平胸龜、大頭烏龜、黑頸水龜、烏龜、黃緣盒龜、黃額盒龜、黃金龜、金頭閉殼龜、百色閉殼龜、潘氏閉殼龜、瓊崖閉殼龜、周氏閉殼龜、齒緣龜、艾氏擬水龜、黃喉擬水龜、臘戍擬水龜、缺頜花龜、菲氏花龜、中華花龜、鋸緣攝龜、眼斑龜、擬眼斑龜等。昆蟲綱 INSECTA 17目72科120屬另110種江西叉突襀、海南華鈕襀、吉氏小扁襀、史氏長卷襀、怪螳屬（所有種）、魏氏巨蝓、四川無肛蝓、尖峰嶺彪蝓、汙色無翅刺蝓、葉蝓屬（所有種）、廣西瘤蝓、褐脊瘤胸蝓、中華仿圓筒蝓、食蚧雙突圍齧、線斑觸齧、黃脊扁角紋薊馬、墨脫埃蛾蠟蟬、紅翅梵蠟蟬、漆點旌翅顏蠟蟬、碧蟬屬（所有種）、彩蟬屬（所有種）、琥珀蟬屬（所有種）、硫磺蟬屬（所有種）、擬紅眼蟬屬（所有種）、篤蟬屬（所有種）、西藏管尾犁胸蟬、周氏角蟬、新象棘蟬、野核桃聲毛管蚜、柳粉蝨蚜、田鱉、山字寬盾蝽、海南杆蝓豬蝽、中華脈齒蛉、碩華盲蛇蛉、中華旌蛉、雙鋸球胸虎甲、步甲屬拉步甲亞屬（所有種）、步甲屬碩步甲亞屬（所有種）等合計 5綱 46目 177科 1591種 及 昆蟲120屬的所有種和另外110種。