褐藻，這個是開缸初期最容易生長的藻類。原因是魚缸的硝化系統還沒有建立好，生態不穩定。水草剛剛種植，不能吸收水裡的營養物質，導致褐藻大量生長。所以只要儘快建立硝化系統，控制液肥的加入，水草穩定了，褐藻就會慢慢消失。或者加入黑殼蝦、螺類除藻，因為水質不太穩定，先不推薦下魚。

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絲藻，出現在褐藻剛剛消失的階段。絲藻纏繞在水草上，讓人很是頭痛。這個可以手動清除，用筷子纏繞、鑷子纏繞清除。也可以下生物清除絲藻。

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綠斑藻。這也是草缸中很常見的一種藻類，產生的原因是養份過剩或養份不均勻、光照太強太長、CO2濃度較低、磷酸鹽度低。出現這種藻類，可以用蝦、螺、鼠魚清除。對於魚缸缸壁上的，可以手動用刮藻刀或者銀行卡等刮除。對於生長較多植物可以予以清除。

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剛毛藻，水裡二氧化碳含量低的時候，會產生剛毛藻。這種藻類是草缸裡非常頑固的一種藻類的，讓人很頭痛。主要清除方式是手動清除，等藻類生長成一團的時候，手動清除。再用稀釋後（濃度2%）的戊二醛，噴向長藻的地方。

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黑毛藻，這種藻類是最難清除、最頑固的。使用生物清除幾乎不可能。使用刮藻刀也是束手無策。我所瞭解（自己也實驗了）較為有效的一種方法是使用稀釋後的戊二醛，但是會對水體裡的生物造成影響，所以加的量一定要控制少，儘量少加，對黑毛藻點射。