1.體積小、比表面積大：微生物的大小以μm計，但比表面積（表面積/體積）大，必然有一個巨大的營養吸收，代謝廢物排洩和環境資訊接受面。這一特點也是微生物與一切大型生物相區別的關鍵所在。

2、吸收多、轉化快：這一特性為高速生長繁殖和產生大量代謝物提供了充分的物質基礎。

3、生長旺、繁殖快：生長繁殖率極高，如大腸桿菌在20-30分鐘內分裂一次，如果連續分裂，48小時內2.2*10^43個細菌數量增加，營養消耗、代謝積累和限制生長速度。這種特性可以在短時間內將大量的基板轉化為有用的產品，縮短研究週期。還有一些缺點，如疾病、糧食黴變。

4、適應強、易變異：極其靈活適應性，對極端環境具有驚人的適應力，遺傳物質易變異。更重要的是在於微生物的生理代謝型別多、代謝產物種類多。

5、分佈廣、種類多：分佈區域廣，分佈環境廣。生理代謝種類繁多，代謝產物種類繁多，代謝產物種類繁多。更重要的是，微生物有多種生理代謝和代謝產物。微生物可以在其他有機體生存的任何環境中發現，而微生物也可以存在於其他有機體無法生存的極端環境中。

6、 易於變異，產生突變：微生物由於其體積小、比表面積大，易受環境條件的影響。在紫外線輻射、生物誘變劑和環境中的一些營養因子的變化中，微生物自覺地、強制性地改變其遺傳結構，導致變異。據統計，在自然條件下，微生物個體變異的機率是百萬分之一。