按商業模式分類，跨境電子商務主要有Ｂ２Ｂ、Ｂ２Ｃ和Ｃ２Ｃ三種模式。

Ｂ２Ｂ跨境電商，即ＢｕｓｉｎｅｓｓｔｏＢｕｓｉｎｅｓｓ，又稱線上批發，是外貿企業間透過網際網路進行產品、服務及資訊交換的一種商業模式。Ｂ２Ｂ跨境電商企業面對的最終客戶為企業或企業集團。目前，在中國跨境電商市場交易規模中，Ｂ２Ｂ跨境電商市場交易規模佔總交易規模的９０％以上，代表企業主要有敦煌網、中國製造、阿里巴巴國際站和環球資源網等。

Ｂ２Ｃ跨境電商和Ｃ２Ｃ跨境電商統稱線上零售。Ｂ２Ｃ，即ＢｕｓｉｎｅｓｓｔｏＣｏｎｓｕｍｅｒ，是跨境電商企業針對面對個人消費者開展的網上零售活動。目前，Ｂ２Ｃ類跨境電商在中國整體跨境電商市場交易規模中的佔比不斷升高，代表企業主要有速賣通、蘭亭集勢、米蘭網、大龍網等。

Ｃ２Ｃ跨境電商，即ＣｏｎｓｕｍｅｒｔｏＣｏｎｓｕｍｅｒ，是從事外貿活動的個人對國外個人消費者進行的網路零售商業活動。目前，中國的跨境電商出口以Ｂ２Ｂ和Ｂ２Ｃ為主，進口以Ｂ２Ｃ為主。

除上述三種之外，Ｆ２Ｃ跨境電商也日漸興起，它指的是ＦａｃｔｏｒｙｔｏＣｏｎｓｕｍｅｒ，即從工廠到消費者。Ｆ２Ｃ模式直接把出自加工廠的產品送到消費者手中，可以理解為工廠藉助於網路平臺進行的產品直銷ꎮＦ２Ｃ使消費者線上向工廠下訂單成為可能，是Ｂ２Ｃ模式的升級版。Ｆ２Ｃ最大的優勢就是強有力的線下產業支撐、有效的全程品控、快速的市場反應，這是Ｂ２Ｃ跨境電商無法抗衡的。